其他(表面声波(SAW)生物传感器) 2009

Aptamers and biosensors.

Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) Gronewold TM
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组成图示

Aptamers and biosensors. 传感器构成示意图

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传感器类型

其他(表面声波(SAW)生物传感器)

检测对象

凝血酶 (thrombin)、弹性蛋白酶 (elastase,参考蛋白);样品基质:结合缓冲液(20 mM Tris-HCl, pH 7.4, 140 mM NaCl, 5 mM KCl, 1 mM MgCl2)

检测原理

该传感器采用无标记表面声波检测。DNA抗凝血酶适配体通过EDC/NHS酰胺键固定于MUA-SAM,或通过链霉亲和素–生物素固定于CM-dextran三维基质。当凝血酶流经表面时,与适配体特异性结合,形成蛋白–适配体复合物,使传感器界面质量增加。Love波在导波层中的相速度对质量负载敏感,结合量增加导致相移增大;振幅变化反映流体粘度/粘弹性,参考通道可将其与质量信号分离。结合过程按1:1模型进行,浓度升高时结合量与相移增大,停止注射后解离,0.1 N NaOH再生。仪器灵敏度约为515 ° cm2/mg,可实时获得kon、koff和KD。

检测灵敏度

灵敏度: 515 ° cm2/mg

效应效果

两种固定化表面的KD相近,SAM约260 nM,葡聚糖约267 nM,与先前300–400 nM一致。1 mM凝血酶在葡聚糖表面相移约3.7°,相当于7.2 ng/cm2或196 fmol/cm2;SAM相移约1.7°,相当于3.3 ng/cm2或90 fmol/cm2,SAM结合量仅为葡聚糖的约45%,而适配体装载量仅差约4%。1 mM弹性蛋白酶相移约0.3°,相当于0.58 ng/cm2或14 fmol/cm2,约为凝血酶的5–7%,显示选择性。表面可用0.1 N NaOH再生,适配体表面可长期保存,芯片可重复使用数百次,适合凝血级联反应的实时监测。

传感器的构成

  • 基底/换能器:S-sens K5 Love-wave 表面声波(SAW)传感器芯片(石英基底),通过相移和振幅转换质量负载
  • 二维修饰层:11-巯基十一烷酸(MUA)烷硫醇自组装单分子层(SAM),提供羧基用于EDC/NHS偶联
  • 三维修饰层:11-巯基-1-十一烷醇(MHU)SAM经环氧氯丙烷活化后接枝羧甲基葡聚糖(CM-dextran)水凝胶,提供三维基质与羧基
  • 识别元件:5'-氨基或5'-生物素修饰的DNA抗凝血酶适配体(anti-thrombin DNA aptamer, 15-mer GGT TGG TGT GGT TGG)
  • 桥接/偶联:EDC/NHS羰基二亚胺化学形成酰胺键,或链霉亲和素(streptavidin)与生物素结合
  • 封闭剂:1 mM乙醇胺盐酸盐(ethanolamine-hydrochloride, pH 8.5),封闭未反应羧基/氨基
  • 信号标记物:无标记(label-free),凝血酶/弹性蛋白酶结合产生质量负载
  • 读出:S-sens K5仪器记录相移与振幅,并用参考通道区分质量与粘度效应

中文摘要

本文以DNA抗凝血酶适配体与凝血酶相互作用为模型,研究生物传感器表面固定化方式对测量结果的影响。作者将适配体分别通过羧酰胺键固定到二维烷硫醇自组装单分子层(SAM),以及通过链霉亲和素–生物素作用固定到三维羧甲基葡聚糖基质中,并使用S-sens K5 Love波表面声波(SAW)传感器进行无标记实时检测。两种表面测得的平衡解离常数KD分别约为260 nM和267 nM,数值相近;但由于适配体可及性不同,结合分析物量相差约2倍,三维葡聚糖表面结合量更高。以相似蛋白弹性蛋白酶为参考,结果显示两种表面均能区分凝血酶与弹性蛋白酶,说明固定化方式主要影响结合容量和可及性,而不显著改变亲和力,为适配体生物传感器表面设计提供了依据。

英文摘要

The immobilization procedure to a biosensor surface has a major influence on the measurement results. To characterize the immobilization onto various biolayers, the interaction of DNA anti-thrombin aptamer with the protein thrombin was used as a model system. The aptamer was immobilized to a two-dimensional alkanethiol SAM via carboxylamide bonds and to a three-dimensional dextran matrix via streptavidin-biotin interaction. The calculated K (D) values of about 260 and 267 nM, respectively, were comparable, while the amount of bound analyte varied by a factor of 2, depending on the accessibility of the immobilized aptamer. Differences in the specificity were shown by use of the similar protein elastase.

关键词

表面声波传感器DNA适配体凝血酶固定化烷硫醇自组装单分子层葡聚糖基质