其他(光子晶体生物传感器) 2009

Identifying modulators of protein-protein interactions using photonic crystal biosensors.

Journal of the American Chemical Society Heeres JT, Kim SH, Leslie BJ, Lidstone EA, Cunningham BT, Hergenrother PJ
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组成图示

Identifying modulators of protein-pro... 传感器构成示意图

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传感器类型

其他(光子晶体生物传感器)

检测对象

蛋白-蛋白相互作用(protein-protein interactions, PPIs)及小分子调节剂(SM-164、雷帕霉素 rapamycin);样品基质:缓冲液/化合物筛选溶液(384孔板)

检测原理

光子晶体(PC)表面由亚波长聚合物光栅和TiO2构成,共振反射特定波长。链霉亲和素(SA)固定D-生物素-三NTA(BTN),负载Ni2+后螯合His6标签蛋白,形成捕获层。加入对应蛋白(如GST-XIAP、GST-FRB)后,蛋白-蛋白结合使界面质量或折射率增加,峰值波长值(PWV)发生偏移;偏移量随结合蛋白量、结合亲和力和结合状态变化。小分子调节剂(SM-164、雷帕霉素)通过抑制或促进结合改变PWV偏移,从而在384孔板中高通量识别调节剂。该过程无需荧光或抗体标记,直接以光学共振波长变化作为读出信号。

检测灵敏度

原文未报告LOD、线性范围、灵敏度斜率或R^2。

效应效果

该PC生物传感器无需抗体或荧光标记,兼容His6融合蛋白和商用384孔读板,适合高通量筛选。在320个化合物的“大海捞针”实验中,1 μM雷帕霉素可在50 μM筛选化合物背景下被明确识别;SM-164可显著抑制XIAP-caspase-9和XIAP-caspase-7结合,雷帕霉素可增强FKBP12-FRB结合。剂量响应给出IC50:SM-164为0.39 μM,SM-122为2.72 μM。用350 mM EDTA处理后可再生,重复5次结合/剥离仍保持结合能力;若复用5次,筛选200,000个化合物仅需少于20 mg BTN。作者认为该方法通用、低成本,可用于新型蛋白-蛋白相互作用调节剂的高通量发现。

传感器的构成

  • 基底/换能器:光子晶体(PC)表面,亚波长聚合物光栅涂覆TiO2,共振反射单波长并随表面吸附变化
  • 载体板:无底384孔板,承载PC片,用于高通量检测
  • 表面固定层:链霉亲和素(SA)涂层,结合生物素化BTN
  • 连接/螯合层:D-生物素-三NTA(BTN)与SA结合,负载Ni2+后螯合His6标签
  • 捕获识别元件:His6标签蛋白(His6-caspase-9、His6-caspase-7、His6-FKBP12),固定于传感器表面
  • 结合分析物:GST-XIAP或GST-FRB,与捕获蛋白发生蛋白-蛋白相互作用
  • 信号读出:峰值波长值(PWV)偏移,无需荧光或抗体标记

中文摘要

小分子对蛋白-蛋白相互作用的抑制或增强具有重要价值,但高通量鉴定仍困难。现有方法包括ELISA、荧光偏振和SPR,但难以同时满足高通量与多事件检测。本文开发基于光子晶体(PC)生物传感器的高通量检测策略,仅需His6标签蛋白及其对应伴侣蛋白。PC表面由亚波长聚合物光栅涂覆TiO2构成,可共振反射单一波长,生物材料吸附会改变峰值波长值(PWV)。将PC片贴于无底384孔板并用链霉亲和素(SA)修饰后,通过D-生物素-三NTA(BTN)和Ni2+固定His6蛋白。实验证明His6-caspase-3/7/9和FKBP12可剂量依赖结合;GST-XIAP与caspase-7/9结合可被SM-164抑制,FKBP12-FRB结合需雷帕霉素增强。320个化合物的高通量“大海捞针”实验可识别1 μM雷帕霉素。传感器可用350 mM EDTA再生并重复使用5次,且可测定IC50。该方法无需抗体或荧光标记,适用于蛋白-蛋白相互作用调节剂筛选。

英文摘要

Inhibitors and activators of protein-protein interactions are valuable as biological probes and medicinal agents but are often difficult to identify. Herein we describe a high-throughput assay, based upon photonic crystal (PC) biosensors, for the identification of modulators of protein-protein interactions. Through the use of a d-biotin-tris-NTA (BTN) hybrid compound, any His6-tagged protein can be immobilized on the surface of a PC biosensor. Binding of the bound protein to its cognate partner is detected via a shift in the peak wavelength value. We demonstrate this assay with three protein-protein pairs (caspase-9-XIAP, caspase-7-XIAP, FKBP12-FRB) and their small molecule modulators.

关键词

光子晶体生物传感器蛋白-蛋白相互作用高通量筛选小分子调节剂His6标签峰值波长值