电化学生物传感器 2011

Nanoparticle based DNA biosensor for tuberculosis detection using thermophilic helicase-dependent isothermal amplification.

Biosensors & bioelectronics Torres-Chavolla E, Alocilja EC
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组成图示

Nanoparticle based DNA biosensor for ... 传感器构成示意图

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传感器类型

电化学生物传感器

检测对象

结核分枝杆菌复合群(Mycobacterium tuberculosis complex, MTC)特异性 IS6110 DNA 片段;样品基质:合成单链 DNA(ssDNA)模板,文中未实际检测痰液等生物样品

检测原理

首先用嗜热解旋酶依赖等温扩增(tHDA)在 65 ℃ 下扩增结核分枝杆菌复合群特异性 IS6110 片段,无需热循环仪。扩增产物变性后,与胺基磁性颗粒(MPs)上的捕获 DNA 探针杂交,经磁分离去除未结合目标;随后加入偶联报告 DNA 探针的糊精包覆金纳米颗粒(AuNPs),与目标另一端杂交形成 MP–target–AuNP 三明治复合物,再次磁分离并转移至丝网印刷碳电极(SPCE)。加入 1 M HCl 溶解 AuNPs 生成 Au3+,在 SPCE 上以差分脉冲伏安法(DPV)将 Au3+ 还原为金,产生 0.30–0.35 V 电流峰。峰高随目标 DNA 浓度呈对数线性变化,信号放大来自 tHDA 扩增与 AuNP 电化学标记。

检测灵敏度

LOD: 0.01 ng/µl(105 bp 等温扩增目标);线性范围: 0.01–10 ng/µl(对数线性);半定量 LOD: 0.1 ng/µl

效应效果

该研究以合成单链 DNA 作为概念验证模板,未报告实际痰液样品回收率、RSD 或交叉反应选择性数据。DPV 金还原峰位于 0.30–0.35 V,三次独立试验中每个浓度均做三次重复;在 0.01–10 ng/µl 范围内呈对数线性关系,但 0.1 与 0.01 ng/µl 峰高存在变异,作者归因于低浓度下颗粒分散和可及表面积差异,因此给出半定量检测限 0.1 ng/µl。糊精包覆 AuNPs 与柠檬酸包覆 AuNPs 电化学标记效果无差异。整个检测(不含 DNA 提取)约 6 h,无需热循环仪,可用普通加热块或水浴及手持电位计,适合资源受限的外围实验室。

传感器的构成

  • 换能器电极:丝网印刷碳电极(SPCE),工作电极为碳、参比电极为银/氯化银,用于差分脉冲伏安法(DPV)检测金离子还原峰
  • 捕获纳米颗粒:胺基修饰磁性颗粒(MPs,约1 μm),经 sulfo-SMCC 偶联捕获 DNA 探针(TB 3′thiol),用于捕获目标 DNA 并实现磁分离
  • 报告纳米颗粒:糊精包覆金纳米颗粒(dextrin-coated AuNPs,约12.5 nm),经配体交换偶联报告 DNA 探针(TB 5′thiol),作为电化学信号标记
  • 识别元件:两条 DNA 探针分别识别 tHDA 扩增的 IS6110 片段两端,形成 MP–target–AuNP 三明治复合物
  • 封闭剂:sulfo-NHS acetate,用于封闭 MPs 表面未反应连接基团
  • 信号转换试剂:1 M HCl,溶解 AuNPs 生成 Au3+,在 SPCE 上经 DPV 还原为金并产生电流信号

中文摘要

本研究报道了一种基于 DNA 的生物传感器,用于检测结核分枝杆菌复合群(Mycobacterium tuberculosis complex, MTC)。该传感器采用嗜热解旋酶依赖等温扩增(tHDA)扩增 MTC 特异性 IS6110 基因片段,并以糊精包覆金纳米颗粒(dextrin-coated AuNPs)作为电化学报告标记。胺基修饰磁性颗粒(MPs)和金纳米颗粒分别偶联两条不同 DNA 探针,特异性识别扩增片段两端;杂交后形成 MP–目标 DNA–AuNP 三明治复合物,经磁分离后转移至丝网印刷碳电极(SPCE)。金纳米颗粒在酸性条件下溶解为 Au3+,并通过差分脉冲伏安法(DPV)在碳电极上还原产生电流峰。该体系对等温扩增目标 DNA 的检测限为 0.01 ng/µl,有望结合便携式手持电位计用于外围实验室的结核快速检测。

英文摘要

The present study describes the development of a DNA based biosensor to detect Mycobacterium tuberculosis using thermophilic helicase-dependent isothermal amplification (tHDA) and dextrin coated gold nanoparticles (AuNPs) as electrochemical reporter. The biosensor is composed of gold nanoparticles (AuNPs) and amine-terminated magnetic particles (MPs) each functionalized with a different DNA probe that specifically hybridize with opposite ends of a fragment within the IS6110 gene, which is M. tuberculosis complex (MTC) specific. After hybridization, the formed complex (MP-target-AuNP) is magnetically separated from the solution and the AuNPs are electrochemically detected on a screen printed carbon electrode (SPCE) chip. The obtained detection limit is 0.01 ng/μl of isothermally amplified target (105 bp). This biosensor system can be potentially implemented in peripheral laboratories with the use of a portable, handheld potentiostat.