荧光生物传感器 2011

DNA capturing machinery through spore-displayed proteins.

Letters in applied microbiology Park TJ, Lee SJ, Pan JG, Jung HC, Park JY, Park JP, Lee SY
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组成图示

DNA capturing machinery through spore... 传感器构成示意图

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传感器类型

荧光生物传感器

检测对象

病原菌 DNA(铜绿假单胞菌 Pseudomonas aeruginosa、鲍曼不动杆菌 Acinetobacter baumannii、大肠杆菌 Escherichia coli、肺炎克雷伯菌 Klebsiella pneumoniae,细菌基因组 DNA/PCR 产物);Wilson 病 ATP7B 基因 R778 位点突变(R778P/L/Q,患者/非患者基因组 DNA)

检测原理

该传感器以 Bacillus thuringiensis 芽孢为稳定生物基底,表面通过 pSD-SA 展示 core streptavidin。链霉亲和素与生物素标记 DNA 探针发生强特异性结合,探针再与病原菌 16S/23S rDNA 或 Wilson 病 ATP7B 突变序列杂交。靶标 DNA 上携带 FITC 荧光标记,结合/杂交事件使荧光分子富集于芽孢表面。每个芽孢可展示约700–800个链霉亲和素,每个链霉亲和素可结合4–5个生物素,形成多价捕获与信号放大。靶标 DNA 浓度越高,杂交并保留的 FITC 标记分子越多,荧光强度越强,最终由 SpectraMax M2 微孔板读取 RFU 信号。

检测灵敏度

原文未报告 LOD、线性范围、灵敏度斜率或 R^2。

效应效果

系统对四种病原菌 DNA 均产生明显荧光,展示芽孢平均荧光较背景提高约2–4倍,无展示对照荧光低,显示一定选择性;杂交后30 min 内完成检测。Wilson 病 SNP 中,正常 R778R 与正常 DNA 完全杂交,R778L 和 R778Q 突变可被检测,R778P 信号较低,可能与杂交构象有关。芽孢表面可展示约700–800个链霉亲和素,每个结合4–5个生物素,提供多价捕获与信号增强。作者强调芽孢耐热耐化学、可低成本量产,适合作为病原菌和遗传病 DNA 诊断的简单平台;未报告 RSD、回收率或与 ELISA/PCR 的定量对比。

传感器的构成

  • 生物基底/换能载体:Bacillus thuringiensis 4Q7 芽孢(spore),提供稳定表面并承载展示蛋白
  • 基因表达/锚定层:pSD-SA 质粒、inhA 启动子与外鞘蛋白 InhA 锚定系统,使 core streptavidin 展示于芽孢表面
  • 识别元件:core streptavidin(链霉亲和素),特异性结合生物素(biotin)
  • 靶标捕获探针:生物素标记 DNA 探针(biotinylated DNA probe,3′-biotin),与病原菌 16S/23S rDNA 或 ATP7B 突变序列杂交
  • 信号标记物:FITC 荧光标记 DNA/肽(FITC-conjugated DNA/peptide),提供荧光信号
  • 检测介质:PBS(pH 7.4)及 6×SSPE/甲酰胺杂交液,用于杂交与清洗
  • 信号读出:SpectraMax M2 微孔板荧光读数(fluorescence microplate reader),输出 RFU

中文摘要

本研究旨在开发一种利用链霉亲和素展示芽孢作为分子机器的简便 DNA 生物传感器新方法。作者将 core streptavidin 基因克隆至 Bacillus thuringiensis 4Q7 芽孢表达载体 pSD-SA,使链霉亲和素展示于芽孢表面,并以荧光光谱作为监测工具,用于确认表面展示及 DNA 检测。作为概念验证,研究采用铜绿假单胞菌、鲍曼不动杆菌、大肠杆菌和肺炎克雷伯菌的 16S/23S rDNA 区域 PCR 产物,通过生物素标记探针与芽孢表面链霉亲和素结合,检测病原菌 DNA;同时利用 ATP7B 基因 R778 位点正常及突变序列,检测 Wilson 病单核苷酸多态性。结果表明,链霉亲和素展示芽孢可有效捕获 DNA 靶标,用于病原菌检测和 Wilson 病突变分析。该策略可作为开发高灵敏度芽孢基生物传感器的简单平台,适用于诊断中任意所需 DNA 靶标。

英文摘要

AIMS: The purpose of this study was to develop a general method for the facile development of a new DNA biosensor which utilizes streptavidin-displayed spores as a molecular machinery. METHODS AND RESULTS: Fluorescence spectroscopy was used as a monitoring tool for the streptavidin displayed on the surface of Bacillus thuringiensis spores and as a diagnosis method for DNA detection. As a proof-of-concept, four pathogenic bacteria including Pseudomonas aeruginosa, Acinetobacter baumannii, Escherichia coli and Klebsiella pneumonia were used for the detection of pathogenic species. In addition, a set of mutant variants of Wilson's disease were also used for the detection of single nucleotide polymorphism (SNP) in this system. CONCLUSIONS: This strategy, utilizing streptavidin-displayed spores, is capable of capturing DNA targets for the detection of pathogenic bacteria and for mutation analysis in Wilson's disease. SIGNIFICANCE AND IMPACT OF THE STUDY: This approach could be useful as a simple platform for developing sensitive spore-based biosensors for any desired DNA targets in diagnostic applications.