电化学生物传感器 2011

A simple and ultrasensitive electrochemical DNA biosensor based on DNA concatamers.

Chemical communications (Cambridge, England) Chen X, Lin YH, Li J, Lin LS, Chen GN, Yang HH
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组成图示

A simple and ultrasensitive electroch... 传感器构成示意图

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传感器类型

电化学生物传感器

检测对象

目标 DNA(target DNA, TD,HIV-1 U5 LTR 38-mer);样品基质:1 M NaClO4 溶液、1:1 稀释 HeLa 细胞裂解液

检测原理

捕获探针 CP 通过金–硫醇化学固定于金电极,目标 DNA TD 的 5'端与 CP 杂交,3'端与二茂铁标记信号探针 SP 杂交。辅助探针 AP 可识别 SP 上两个不同区域,使 AP 与 SP 交替杂交并自组装成携带大量 Fc 的长 DNA concatamer。TD 的存在将长 concatamer 触发连接到电极表面,使大量 Fc 氧化还原标记靠近电极。DPV 测量 Fc 的氧化还原峰电流,电流随 TD 浓度增加而增大。双链 DNA 的有序碱基堆积还可改善 DNA 介导电荷传输,进一步放大信号。

检测灵敏度

LOD: 100 aM;线性范围: 100 aM–1 nM;R^2 = 0.9967

效应效果

该传感器无需酶或复杂设备,检测限达 100 aM,较传统 DNA 三明治法(100 pM)提高 1000 倍,灵敏度接近 PCR。在 1 nM 下,完全互补目标 DNA 与单碱基错配目标 DNA 的峰电流比约为 6:1,显示良好序列特异性。在 1:1 稀释 HeLa 细胞裂解液中,信号略低于 1 M NaClO4 中的响应,但仍能区分不同浓度目标 DNA,表明可耐受复杂基质干扰。文中以五次重复测量的标准差误差棒展示重现性,但未给出 RSD、稳定性或加标回收率数值。作者认为其可用于 DNA 诊断和临床分析。

传感器的构成

  • 基底/换能器电极:金电极(Au electrode),提供电子转导与 DPV 信号读出
  • 封闭剂:甲硫醇(MCH),封闭金电极表面非特异性吸附位点
  • 识别元件:捕获探针(CP,3'-端 (CH2)6-SH 修饰寡核苷酸),通过金–硫醇化学固定于金电极,与目标 DNA 5'端杂交
  • 被测物:目标 DNA(TD,HIV-1 U5 LTR 38-mer),一端结合 CP,另一端触发 concatamer 连接
  • 信号标记物:二茂铁标记信号探针(SP,ferrocene-labeled signal probe),与目标 DNA 3'端杂交,提供 Fc 氧化还原信号
  • 信号放大元件:辅助探针(AP,auxiliary probe),与 SP 两个不同区域杂交,使 AP 与 SP 自组装形成长 DNA concatamer
  • 检测介质:1 M NaClO4,提供离子环境并支持 DPV 测量

中文摘要

本文报道了一种基于 DNA concatamer 的简单、超灵敏且选择性电化学生物传感器,用于痕量 DNA 检测。传感器以金电极为基底,通过金–硫醇化学将 3'-巯基捕获探针(CP)固定于电极表面,并用甲硫醇(MCH)封闭非特异性位点。带二茂铁(Fc)标记的信号探针(SP)与辅助探针(AP)可在溶液中通过 AP 与 SP 两个不同区域的杂交自组装形成长 DNA concatamer。当目标 DNA(TD)存在时,其 5'端与 CP 杂交,3'端与 SP 杂交,从而触发长 concatamer 连接到电极表面。由于每条 concatamer 携带大量 Fc 氧化还原标记,差分脉冲伏安法(DPV)峰电流显著放大。该传感器可在未优化条件下检测低至 100 aM 的目标 DNA,线性范围为 100 aM 至 1 nM,相关系数 0.9967,并能在 1:1 稀释 HeLa 细胞裂解液中保持良好响应,具有用于 DNA 诊断和临床分析的潜力。

英文摘要

A simple, ultrasensitive and selective electrochemical DNA biosensor based on DNA concatamers is described, which can detect as low as 100 aM target DNA even in complex samples.