量子点生物传感器 2012

A quantum dot-intercalating dye dual-donor FRET based biosensor.

Chemical communications (Cambridge, England) Zhang H, Zhou D
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组成图示

A quantum dot-intercalating dye dual-... 传感器构成示意图

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传感器类型

量子点生物传感器

检测对象

互补DNA(complementary DNA,DNA1/DNA2/DNA3,Atto-647N标记)、凝血酶(thrombin,TB);样品基质:PBS缓冲液(含0.6 μM EB)溶液。

检测原理

该传感器基于QD-EB双供体FRET。GSH-QD表面通过EDC/NHS偶联固定抗凝血酶适配体TBA。DNA检测时,Atto-647N标记的互补DNA与TBA杂交形成双链,EB优先嵌入双链并增强约20倍荧光;450 nm激发下,QD和EB同时向Atto-647N传递能量,665 nm受体FRET峰随DNA浓度增加,I665/I550线性上升。蛋白检测时,TB与TBA适配体结合并置换互补DNA,使受体远离QD,FRET减弱,QD 550 nm荧光恢复,IQD/IDye随log[TB]线性增加。比值读出降低仪器噪声影响。

检测灵敏度

DNA: LOD: ~0.5 nM;线性范围: 0-160 nM;斜率: 15.6、6.65、6.08 × 10^-4 nM^-1(DNA1、DNA2、DNA3);R^2 = 0.991、0.984、0.986。TB: LOD: ~30 pM;线性范围: 0.1-10 nM(log[TB]);R^2 = 0.985。

效应效果

该传感器对DNA靶标选择性良好:非互补DNA几乎无FRET信号,单碱基错配DNA信号显著低于完全匹配DNA,可实现SNP级区分;多数已报道QD-FRET DNA传感器区分比通常小于3。蛋白检测中,100 pM TB即可产生显著QD荧光增强,TB检出限约30 pM,比单供体QD-FRET TB传感器低2-4个数量级,与部分电化学TB传感器相当。比值读出对仪器噪声不敏感。文中未报告RSD、稳定性或实际样品回收率,作者认为可扩展至其他适配体用于生物传感、环境监测和疾病诊断。

传感器的构成

  • 换能器/纳米供体:GSH封端CdSe-ZnS核壳量子点(GSH-QD,λEM≈540 nm,晶粒直径≈3.4 nm),作为主FRET供体与荧光换能元件
  • 表面偶联层:EDC/NHS介导的酰胺偶联,将TBA 5' C6-胺连接到GSH-QD表面COOH,平均每个QD约5条TBA(QD-TBA5)或4条(QD-TBA4)
  • 识别元件:29-mer抗凝血酶适配体序列(TBA,anti-thrombin aptamer),用于识别TB蛋白;DNA检测中与互补DNA杂交形成双链
  • 信号受体:3' Atto-647N标记的互补DNA(DNA1/DNA2/DNA3),作为FRET受体,杂交后靠近QD产生约665 nm FRET信号
  • 第二供体/嵌入染料:溴化乙啶(EB),优先嵌入TBA-DNA双链,荧光增强约20倍,作为第二FRET供体向Atto-647N传能
  • 检测介质:PBS缓冲液(含0.6 μM EB),用于无分离均相荧光检测
  • 读出方式:荧光光谱仪,450 nm激发,监测Atto-647N FRET峰(约665 nm)与QD峰(约550 nm)强度比

中文摘要

本文报道了一种新型量子点-嵌入染料双供体Förster共振能量转移(FRET)生物传感器,用于灵敏检测pM级DNA和蛋白靶标。量子点具有宽吸收和窄对称发射,适合FRET传感,但传统QD-FRET体系中QD为唯一供体,且商业水溶性QD水动力半径(7.5-15 nm)常大于典型QD-染料FRET对的Förster半径(4-7 nm),导致供体-受体距离要求严格。作者首次提出QD-溴化乙啶(EB)双供体FRET系统:QD和嵌入双链DNA的EB均可向染料受体传递能量,显著提高每次靶标DNA结合的整体FRET效率。通过在QD-DNA偶联物中引入特异性适配体序列,该体系可检测亚nM级标记DNA并区分单碱基错配;结合抗凝血酶适配体后,可实现无标记凝血酶检测,检出限约30 pM,比单供体QD-FRET蛋白传感器高2-4个数量级。

英文摘要

We report herein the development of a novel quantum dot-intercalating dye dual-donor FRET system that can be used for sensitive detection of pM level DNA and protein targets.