电化学生物传感器 2012

Enzyme-free and label-free ultrasensitive electrochemical detection of human immunodeficiency virus DNA in biological samples based on long-range self-assembled DNA nanostructures.

Analytical chemistry Chen X, Hong CY, Lin YH, Chen JH, Chen GN, Yang HH
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组成图示

Enzyme-free and label-free ultrasensi... 传感器构成示意图

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传感器类型

电化学生物传感器

检测对象

人免疫缺陷病毒DNA(HIV DNA,HIV-1 U5 LTR序列);样品基质:HeLa细胞裂解液、人血清(1:1稀释)

检测原理

传感器以金电极为工作电极,巯基捕获探针CP通过Au-S化学固定于表面。HIV-1 U5 LTR靶DNA(TD)一端与CP杂交,另一端与辅助探针AP1的3′端互补片段杂交;AP1与AP2之间通过互补片段级联杂交,自组装成微米级一维DNA纳米结构并被锚定到电极。DNA骨架带负电,可静电结合大量氧化还原指示剂RuHex([Ru(NH3)6]3+)。在DPV中,RuHex发生还原反应,峰电流与电极表面RuHex数量成正比。靶DNA浓度越高,连接并锚定的DNA纳米结构越多,负载的RuHex越多,还原峰电流越大,因此信号随靶DNA浓度增加而增强。

检测灵敏度

LOD: 2 aM(缓冲液直接测量);LOD: 5 aM(细胞裂解液/人血清);线性范围: 2 aM–10 pM(对数线性);R^2 = 0.9972

效应效果

该传感器在缓冲液中直接检测限为2 aM,在1:1稀释的HeLa细胞裂解液和人血清中检测限为5 aM,约相当于6 μL样品中30 yoctomoles或18个寡核苷酸拷贝。选择性方面,10 pM完全互补靶DNA与1 nM单碱基错配、双碱基错配及非互补序列相比,对TD与1MT可实现4:1区分,表明其能识别单碱基错配。复杂生物基质中信号略有下降、空白略升高,但仍保持良好检测能力。作者认为其灵敏度与PCR相当,且无需酶、标记物和复杂仪器,具有低成本、便携和临床DNA诊断应用潜力。文中未报告稳定性、重现性RSD和加标回收率。

传感器的构成

  • 基底/换能器电极:金电极(Au electrode,2 mm),经piranha溶液、氧化铝抛光和电化学清洗,作为工作电极。
  • 识别元件:巯基修饰捕获探针(CP,CAGTGTGGAAAATCTCTAGC-(CH2)6-SH),通过Au-S化学固定于金表面,捕获HIV-1 U5 LTR靶DNA。
  • 封闭剂:6-巯基-1-己醇(MCH,2 mM),封闭金表面并减少非特异性DNA吸附。
  • 信号放大修饰层:辅助探针AP1和AP2(各1 μM),级联杂交自组装成微米级一维DNA纳米结构,经靶DNA与CP杂交后锚定电极。
  • 信号标记物:六氨合钌(III)氯化物([Ru(NH3)6]3+,RuHex,5 μM),通过静电作用结合DNA磷酸骨架,作为氧化还原指示剂。
  • 检测介质/读出:5 μM RuHex溶于10 mM Tris-HCl(pH 7.4),三电极体系(Ag/AgCl参比、Pt对电极)进行DPV。

中文摘要

本文报道了一种基于长程自组装DNA纳米结构的无酶、无标记超灵敏电化学DNA生物传感器,用于复杂生物样品中人免疫缺陷病毒(HIV)DNA的检测。作者设计了两种辅助探针AP1和AP2,二者通过级联杂交可自组装形成微米级一维DNA纳米结构。当存在靶DNA时,每个靶DNA分子可作为触发器,将其一端与电极表面捕获探针杂交,另一端通过AP1连接自组装DNA纳米结构。随后,大量氧化还原指示剂六氨合钌(III)([Ru(NH3)6]3+,RuHex)通过静电作用结合到带负电的DNA磷酸骨架上,从而在差分脉冲伏安法中产生显著放大的还原峰电流。该传感器在复杂生物样品中可实现5 aM的HIV DNA检测限,具有简单和超灵敏的特点。

英文摘要

Biosensors based on nanomaterials have been used for detection of various biological molecules with high sensitivity and selectivity. Herein, we developed a simple and ultrasensitive electrochemical DNA biosensor using long-range self-assembled DNA nanostructures as carriers for signal amplification, which can achieve an impressive detection limit of 5 aM human immunodeficiency virus (HIV) DNA even in complex biological samples. In this study, we designed two auxiliary probes. A cascade of hybridization events between the two auxiliary probes can lead to long-range self-assembly and form micrometer-long one-dimensional DNA nanostructures. In the presence of target DNA, each copy of the target can act as a trigger to connect a DNA nanostructure to a capture probe on the electrode surface. Then, a great amount of redox indicator [Ru(NH(3))(6)](3+) can be electrostatically bound to the DNA nanostructures and eventually result in significantly amplified electrochemical signals.