全细胞生物传感器 2011

Green fluorescent protein-based biosensor to detect and quantify stress responses induced by DNA-degrading colicins.

Applied and environmental microbiology Abraham S, Chin J, Brouwers HJ, Turner B, Zhang R, Chapman TA
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组成图示

Green fluorescent protein-based biose... 传感器构成示意图

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传感器类型

全细胞生物传感器

检测对象

DNA 降解型大肠菌素(DNA-degrading colicins,E2、E7、E8);样品基质:大肠菌素上清液(LB 稀释)

检测原理

DNA 降解型大肠菌素 E2、E7 或 E8 作用于大肠杆菌 MG1655 后,降解或损伤细胞 DNA,触发基因毒性应激并激活 SOS 响应。SOS 响应型 cda 启动子因此被激活,驱动下游 gfp 融合基因转录,使 GFP 蛋白在细胞内积累。GFP 在 485 nm 激发下产生 535 nm 发射荧光,荧光强度随 cda 启动子活性和 GFP 表达量增加而升高。实验以处理组平均荧光与阴性对照平均荧光之比计算诱导因子 IF,同时监测 OD600 以评估细胞生长和细胞毒性。该体系通过基因表达放大将 DNA 损伤事件转换为可实时读出的荧光信号。

检测灵敏度

原文未报告 LOD、线性范围、灵敏度斜率或相关系数;显著诱导阈值: IF ≥ 1.5;显著基因毒性应激: IF > 3。

效应效果

该传感器对 DNA 降解型大肠菌素 E2、E7、E8 均产生显著 SOS 荧光诱导,呈剂量和时间依赖;成孔型(A、B、E1、Ia、Ib)和 RNA 降解型(E3、E4、E5、E6、D)大肠菌素不诱导 cda-GFP 信号,显示机制选择性。阴性对照 BZB1011 上清无诱导。E2 在 0.03% 和 0.01%、E7 在 0.52% 和 0.13% 上清时 IF>4,E8 在 0.01% 时最大 IF 为 3.5;高于 2.08% 时 IF 先升后降且 OD600 持续下降,反映细胞毒性。最佳检测时间为 90–120 min。作者认为该全细胞传感器可快速、实时、特异性地检测大肠菌素作用,并可扩展为多启动子阵列。

传感器的构成

  • 细胞基底/换能器:大肠杆菌 K-12 MG1655 全细胞,作为识别与信号转导平台
  • 遗传修饰层:质粒 pANO1::cda,携带 cda 启动子-gfp 融合,提供 SOS 响应元件
  • 识别元件:SOS 响应型 cda 启动子,响应 DNA 损伤并启动转录
  • 信号标记物:绿色荧光蛋白 GFP(gfpmut3),诱导表达后产生 485/535 nm 荧光
  • 检测介质:LB 培养基与 96 孔板,用于大肠菌素上清孵育和实时荧光/OD 读出

中文摘要

本研究开发了一种基于绿色荧光蛋白的全细胞生物传感器,用于检测和定量 DNA 降解型大肠菌素诱导的大肠杆菌 SOS 应激反应。该传感器菌株为大肠杆菌 K-12 MG1655/pANO1::cda,其中 SOS 响应型 cda 启动子与 gfp 突变体融合;当 DNA 损伤或基因毒性应激激活 SOS 系统时,cda 启动子驱动 GFP 表达,荧光强度随应激程度增加。实验在 96 孔板中以不同浓度大肠菌素上清处理生物传感器,实时监测 485 nm 激发、535 nm 发射荧光及 OD600,并计算诱导因子 IF。结果显示 DNA 降解型大肠菌素 E2、E7 和 E8 均能诱导显著 SOS 反应,呈剂量和时间依赖;成孔型和 RNA 降解型大肠菌素不诱导该荧光信号。该传感器可快速、实时、特异性地检测大肠菌素作用及其细胞毒性。

英文摘要

Here we report the development of a whole-cell biosensor to detect and quantify the induction of the SOS response activated by DNA-degrading colicins. This biosensor utilizes the SOS-responsive cda promoter to regulate the expression of green fluorescent protein. The biosensor assay revealed induction of stress for all DNA-degrading reference colicins (E2, E7, and E8).