微流控生物传感器 2012

Microfluidic nanoplasmonic-enabled device for multiplex DNA detection.

Lab on a chip Peng HI, Strohsahl CM, Miller BL
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组成图示

Microfluidic nanoplasmonic-enabled de... 传感器构成示意图

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传感器类型

微流控生物传感器

检测对象

目标 DNA(target DNA,包括 Bacillus anthracis pag 基因 cDNA、uropathogenic E. coli Eco3a、Enterobacter cloacae Enterbact3a);样品基质为缓冲盐溶液(buffered saline)

检测原理

该传感器基于 DNA 发夹探针的构象开关和银纳米颗粒金属增强荧光(MEF)。无目标 DNA 时,表面固定的发夹探针折叠,3′ 端 TMR 荧光基团靠近 Ag 表面,荧光被能量转移猝灭。当互补目标 DNA 流入微流控通道并与探针杂交时,发夹展开,TMR 远离猝灭表面并进入 Ag NPs 附近的荧光增强区,荧光强度上升。微流控连续流动通过对流快速输送目标 DNA,缩短扩散限制时间;Ag NPs 提供等离子体增强,放大荧光信号。目标浓度越高,杂交探针比例越高,荧光增强越大,直至探针饱和,因此可实现实时定量和多重检测。

检测灵敏度

LOD: 500 pM

效应效果

装置在 0.5 μL/min 流速下 6 min 即可产生显著信号,仅消耗 3 μL 样品;未优化 LOD 为 500 pM。微流控通道可承受 30 μL/min 流速 30 min 而无泄漏,显示良好密封性。多重检测中,500 nM Enterbact3a 目标使对应探针荧光变化约 2232,而 Eco3a 探针约 390,约 6 倍差异,5 min 内可与阴性区分;Eco3a 存在轻微非特异响应,可通过更严格杂交条件降低。数据以 N=3 的均值±标准差表示,片间差异主要来自点阵打印。作者认为该自标记、低样品消耗、实时多重 DNA 检测平台具有快速病原 DNA 筛查应用潜力。

传感器的构成

  • 基底/换能器:显微镜玻璃片(glass slide),经清洗和硅烷化,作为支撑与等离子体增强基底
  • 硅烷化层:3-巯基丙基三甲氧基硅烷(MPTS),在玻璃表面形成硫醇自组装层,用于共价连接银纳米颗粒
  • 纳米材料修饰层:银纳米颗粒(Ag NPs),通过 AgNO3/DMF 共价附着于 MPTS 表面,提供金属增强荧光(MEF)
  • 识别元件:DNA 发夹探针(DNA hairpin probes),5′ trityl-thiol 端固定于 Ag 表面,3′ 标记 TMR,点阵化实现多重检测
  • 共印组分:巯基丙醇(MP),与 DNA 探针共同点样,作为表面间隔组分
  • 微流控通道:PDMS(Sylgard 184)微流控通道(2 cm × 1 mm × 50 μm),UV-ozone 处理后与 Ag 基底共价键合,输送目标溶液
  • 信号标记物:四甲基罗丹明(TMR)荧光基团,作为自标记荧光信号
  • 读出系统:荧光显微镜(Olympus BX-60)配 Hg 灯、531±20 nm 激发滤光片、593±20 nm 发射滤光片、CCD 和 ImageJ,采集荧光强度

中文摘要

本文报道了一种快速、定量、多重、自标记且可实时监测的 DNA 生物传感器。该装置将共价结合在银纳米颗粒(Ag NPs)表面的 DNA 发夹探针点阵化固定在微流控通道内,探针 3′ 端标记四甲基罗丹明(TMR)荧光基团。无目标 DNA 时,发夹探针折叠使 TMR 靠近银表面而被猝灭;互补目标 DNA 杂交后探针展开,TMR 进入金属增强荧光(MEF)区域,荧光增强。装置采用 PDMS 微流控通道与银纳米颗粒玻璃基底共价键合,可在连续流动中实时采集荧光。实验表明,在 0.5 μL/min 流速下,6 min 即可产生显著信号,仅消耗 3 μL 样品;未优化检出限为 500 pM,并可实现多重 DNA 检测。

英文摘要

We describe a rapid, quantitative, multiplex, self-labelled, and real-time DNA biosensor employing Ag nanoparticle-bound DNA hairpin probes immobilized in a microfluidic channel. Capture of complementary target DNAs by the microarrayed DNA hairpin probes results in a positive fluorescence signal via a conformational change of the probe molecules, signalling the presence of target DNAs. The device's capability for quantitative analyses was evaluated and a detection time as low as 6 min (with a target flow rate of 0.5 μl min(-1)) was sufficient to generate significant detection signals. This detection time translates to merely 3 μl of target solution consumption. An unoptimized sensitivity of 500 pM was demonstrated for this device.

关键词

微流控DNA生物传感器银纳米颗粒金属增强荧光多重检测发夹探针