传感器类型
全细胞生物传感器
检测对象
L-甲硫氨酸(L-methionine, L-Met)、L-缬氨酸(L-valine, L-Val)、L-亮氨酸(L-leucine, L-Leu)、L-异亮氨酸(L-isoleucine, L-Ile);样品基质为谷氨酸棒杆菌胞内氨基酸/发酵培养液(细胞悬液)
检测原理
该传感器利用谷氨酸棒杆菌天然转录调控因子 Lrp 作为识别元件。当胞内 L-Met、L-Leu、L-Ile 或 L-Val 浓度升高时,氨基酸与 Lrp 结合并改变其构象,使 Lrp 结合 lrp-brnF 间区中的 brnF 启动子(PbrnF),激活下游 eyfp 转录。eyfp 翻译并成熟后形成增强型黄色荧光蛋白 eYFP,在 510 nm 激发下产生 532 nm 发射荧光。荧光强度随胞内氨基酸浓度在低-中 mM 范围内近似线性增加,从而实现单细胞水平的模拟信号读出。二肽喂养通过竞争性摄取和胞内水解调节效应氨基酸浓度;FACS 或荧光显微镜读取单细胞 eYFP 信号,用于在线监测和高通量筛选。
检测灵敏度
LOD: 未报告;最小线性检测范围: L-Met 0.2–23.5 mM、L-Leu 0.2–13.6 mM、L-Ile 0.4–11.5 mM、L-Val 1.5–23.4 mM;最大诱导: 78-fold(L-Met);最高胞内浓度: 25 mM;FACS 可区分 L-Met <1 mM 亚群。
效应效果
传感器对四种效应氨基酸有响应,对 Ala-Ala、Ala-Lys 和空载体无显著信号;Lrp 亲和力递增为 L-Val < L-Ile < L-Leu < L-Met。FACS 可区分胞内 L-Met 低于 1 mM 的亚群。DaceE 在线监测中 eYFP 与 L-Val 产量同步,生产开始 3 h 达峰值。微流控单细胞分析显示荧光、细胞大小和分裂间隔异质性,单细胞倍增时间 0.5–5 h。分选 1500 个细胞,正确率约 95%,存活率约 96%。S1 从约 600 万细胞分选 150 株,48 株中 23% 阳性;S2 高荧光亚群 25% 分泌显著 L-Val,存活率升至近 96%。Top 5 突变体 48 h 产 L-Val 最高 8.7 mM,L-Leu 最高 1.3 mM、L-Ile 最高 2.1 mM。
传感器的构成
- 宿主细胞/换能器:Corynebacterium glutamicum(谷氨酸棒杆菌)野生型或 DaceE 菌株,提供胞内代谢环境与基因表达系统
- 质粒载体:pJC1 穿梭质粒(KanR、oriVEc、oriVCg),携带传感器模块并在 E. coli 与 C. glutamicum 中复制
- 识别元件:Lrp(leucine-responsive protein,亮氨酸响应蛋白),结合胞内 L-Met、L-Leu、L-Ile、L-Val 并激活下游启动子
- 调控启动子:lrp-brnF 间区(含 brnF 启动子 PbrnF),响应 Lrp-氨基酸复合物并驱动报告基因转录
- 信号报告蛋白:eyfp(enhanced yellow fluorescent protein,增强型黄色荧光蛋白),表达后产生 510 nm 激发、532 nm 发射荧光
- 读出装置:荧光显微镜、JASCO FP-6500/6600 荧光分光光度计、BioLector 微孔板系统或 FACSAria II 流式细胞仪,检测 eYFP 荧光
中文摘要
单细菌细胞中特定代谢物的检测与定量是工业生物技术的重要目标。本研究开发了一种基于谷氨酸棒杆菌转录调控因子 Lrp 的全细胞生物传感器,用于检测胞内 L-甲硫氨酸(L-Met)及支链氨基酸 L-缬氨酸(L-Val)、L-亮氨酸(L-Leu)和 L-异亮氨酸(L-Ile)。该传感器将 lrp 基因、lrp-brnF 间区启动子与增强型黄色荧光蛋白 eyfp 融合,使胞内效应氨基酸浓度升高时驱动 eYFP 表达。实验表明,荧光输出与胞质氨基酸浓度呈线性关系;Lrp 对四种氨基酸的亲和力递增为 L-Val、L-Ile、L-Leu 和 L-Met。作者将该传感器用于在线监测丙酮酸脱氢酶缺陷型 C. glutamicum DaceE 菌株的 L-Val 生产,并分析单细胞水平细胞间变异。此外,该系统成功用于随机诱变后的高通量 FACS 筛选,分离出氨基酸生产突变体,展示了转录调控因子在微生物菌种分析、定向进化和高通量筛选中的应用价值。
英文摘要
The detection and quantification of specific metabolites in single bacterial cells is a major goal for industrial biotechnology. We have developed a biosensor based on the transcriptional regulator Lrp that detects intracellular l-methionine and branched-chain amino acids in Corynebacterium glutamicum. In assays, fluorescence output showed a linear relationship with cytoplasmic concentrations of the effector amino acids. In increasing order, the affinity of Lrp for the amino acids is l-valine, l-isoleucine, l-leucine and l-methionine. The sensor was applied for online monitoring and analysis of cell-to-cell variability of l-valine production by the pyruvate dehydrogenase-deficient C. glutamicum strain ΔaceE. Finally, the sensor system was successfully used in a high-throughput (HT) FACS screen for the isolation of amino acid-producing mutants after random mutagenesis of a non-producing wild type strain. These applications illustrate how one of nature's sensor devices - transcriptional regulators - can be used for the analysis, directed evolution and HT screening for microbial strain development.