Charge Transfer Mechanism in Guanine-Based Self-Assembled Monolayers on a Gold Surface.

Langmuir : the ACS journal of surfaces and colloids 2024 Lucia-Tamudo J, Nogueira JJ, Díaz-Tendero S

本工作理论确定了基于鸟嘌呤分子通过不同有机连接基吸附在金表面形成的自组装单层复杂体系的一电子氧化电位与电荷转移机制。通过经典分子动力学模拟采样中性与阳离子物种的构象空间，并在Marcus理论框架下结合先前发展的加和方案，采用多尺度量子力学/分子力学/连续溶剂化模型计算对几何系综的氧化还原电位。该过程同时考虑构象采样、环境描述以及连接...

综述或非传感器论文 鸟嘌呤自组装单层金表面电荷转移一电子氧化电位

Modeling One-Electron Oxidation Potentials and Hole Delocalization in Double-Stranded DNA by Multilayer and Dynamic Approaches.

Journal of chemical information and modeling 2024 Lucia-Tamudo J, Díaz-Tendero S, Nogueira JJ

DNA在纳米导线和电化学生物传感器等新兴应用中的发展，要求深入理解沿DNA链的电荷转移过程及其氧化还原性质。本文结合分子动力学、多层量子力学/分子力学方案和Marcus理论，对覆盖所有核苷酸二元组合的六种双链DNA模型进行计算模拟与详细分析。研究重点为双链DNA的一电子氧化电位和氧化后空穴的离域行为。结果表明，与单链DNA相比，双链...

综述或非传感器论文 双链DNA一电子氧化电位空穴离域分子动力学

One-Electron Oxidation Potentials and Hole Delocalization in Heterogeneous Single-Stranded DNA.

Biochemistry 2023 Lucia-Tamudo J, Alcamí M, Díaz-Tendero S, Nogueira JJ

研究DNA过程不仅对理解其固有生物学功能，而且对其在诸多创新应用中的作用至关重要。将DNA用作纳米线或电化学生物传感器，需要深入研究沿链电荷转移过程及氧化还原性质。本文对不同异质单链DNA（ss-DNA）的一电子氧化电位和氧化后形成的空穴电荷离域进行了计算研究。作者建立两步方案：首先采用量子力学/分子力学（QM/MM）分子动力学模拟...

综述或非传感器论文 单链DNA一电子氧化电位空穴离域电荷传输