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Engineering protein and DNA tools for creating DNA-dependent protein switches.

Methods in enzymology 2022 Sekhon H, Ha JH, Loh SN

可开关蛋白能响应配体结合、pH、温度或光等输入,在失活(OFF)与激活(ON)构象间转换。CRISPR系统中的Cas核酸酶是典型例子,其活性由特定DNA或RNA序列结合调控。虽然Cas酶中寡核苷酸结合调控生物活性的机制复杂且高度特异,但蛋白工程与DNA工程的进展使这种控制模式可引入其他酶。本章重点介绍结合这两类工程手段构建生物传感器...

化学发光生物传感器 蛋白开关交替框架折叠GCN4DNA发夹

Construction of Allosteric Protein Switches by Alternate Frame Folding and Intermolecular Fragment Exchange.

Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) 2017 Ha JH, Loh SN

交替框架折叠(AFF)和蛋白/片段交换(FREX)是用于在无固有变构性质的蛋白中工程化变构构象变化的相关技术。其主要目的之一是将普通结合蛋白转化为生物分子开关,使输入事件转化为光学或功能读出。本章提供将任意结合蛋白改造为具有FRET输出的荧光生物传感器的指南。由于AFF和FREX机制基于蛋白结构与稳定性的普遍原理,而非目标蛋白特有属...