Dynamics design of a non-natural transcription factor responding to androst-4-ene-3,17-dione.

Synthetic and systems biotechnology 2024 Zhao M, Hu M, Han R, Ye C 等 9 人

甾体微生物细胞工厂生产雄烯二酮（androst-4-ene-3,17-dione，AD）需要转录因子（TFs）参与代谢调控。然而，微生物细胞工厂缺乏可有效响应其代谢途径中 AD 的转录因子，且寻找和获得特异性响应 AD 的天然转录因子是一项复杂而繁重的任务。本研究基于结构引导的分子动力学（MD）模拟，设计了一种响应 AD 的人工转录...

全细胞生物传感器 人工转录因子雄烯二酮酵母生物传感器分子动力学

A versatile regulatory toolkit of arabinose-inducible artificial transcription factors for Enterobacteriaceae.

Communications biology 2023

沙门氏菌和埃希氏菌是重要的模式生物、原核表达平台，其致病菌株也构成重大公共卫生威胁。为便于研究与生物技术应用，作者开发了一套阿拉伯糖诱导的人工转录因子（ATF）工具，利用 CRISPR/dCas9 和拟南芥来源的 DNA 结合蛋白，在埃希氏菌和沙门氏菌中于宽诱导剂浓度范围内调控基因表达。不同 ATF 的转录输出差异显著，尤其在改造阿...

全细胞生物传感器 人工转录因子阿拉伯糖诱导沙门氏菌生物碱检测

COMPASS for rapid combinatorial optimization of biochemical pathways based on artificial transcription factors.

Nature communications 2019

多基因平衡表达是构建新生物合成途径或多蛋白细胞复合物的核心。本文报道一种名为 COMPASS（COMbinatorial Pathway ASSembly）的高通量克隆方法，用于在酿酒酵母中实现多基因平衡表达。该方法采用正交的植物来源人工转录因子（ATF）及其结合位点（BS），结合基于同源重组的体内/体外重叠克隆，可并行构建数千个 ...

综述或非传感器论文 合成生物学组合克隆人工转录因子代谢工程