Nature communications
2018
Yeom SJ, Kim M, Kwon KK, Fu Y 等 11 人
生物催化环化对高效合成ε-己内酰胺和δ-戊内酰胺等生物基化学品具有重要意义。为筛选内酰胺生物合成中的环化酶，作者开发了己内酰胺检测型遗传酶筛选系统（CL-GESS）。该系统采用粪产碱杆菌（Alcaligenes faecalis）来源的调控蛋白 NitR，使其能够特异性识别内酰胺化合物，并避免内酰胺生物合成中间体的干扰。作者通过系统...
Scientific reports
2018
Thompson MG, Sedaghatian N, Barajas JF, Wehrs M 等 9 人
pSC101 是一种窄宿主范围、低拷贝质粒，常用于大肠杆菌遗传操作。作者在筛选更敏感的内酰胺生物传感器过程中，意外鉴定出多个可提高 pSC101 起点质粒拷贝数的新突变。所有突变质粒均至少携带一个位于复制起始蛋白 RepA 编码区的突变；同源建模预测多数突变位于 RepA 二聚化界面。突变 RepA 使质粒拷贝数从野生型约 5 拷贝...
ACS synthetic biology
2017
Zhang J, Barajas JF, Burdu M, Ruegg TL 等 6 人
内酰胺是用于制造尼龙等聚酰胺的重要大宗化学品，其中 ε-己内酯年产量达数百万吨。为提升内酰胺的生物合成效率，需要高通量、可筛选的内酰胺传感方法。作者提出一种受小分子药物发现启发的化学信息学策略，即向可代谢化学品生成类似物（AGTC），用于寻找天然转录因子-启动子对。通过 DataWarrior 的 SkelSpheres 描述符生成...