Biosensor characterization: formal methods from the perspective of proteome fractions.

Synthetic biology (Oxford, England) 2025 Vaccari NA, Zevallos-Aliaga D, Peeters T, Guerra DG

许多研究通过转录因子等调控元件在重组系统中控制基因表达，但大多缺乏分析这些调控元件固有及情境依赖变异的正式方法。本研究建立了一个正式框架，并由此推导出表征调控电路的便捷方法。作者将细菌细胞建模为若干蛋白组分数（proteome fractions）的集合，通过对时间依赖蛋白组分数求导，得到描述其变化与表达分数（expression ...

全细胞生物传感器 生物传感器表征蛋白组分数表达分数剂量响应

Development of High-Performance Whole Cell Biosensors Aided by Statistical Modeling.

ACS synthetic biology 2020 Berepiki A, Kent R, Machado LFM, Dixon N

全细胞生物传感器是由细胞组分构成的遗传系统，可将化学物质或其他刺激转化为用户定义的基因表达输出，用于传感与控制。然而，实现最佳性能所需的生物传感器调控组分表达水平并不直观，传统迭代方法难以高效探索多维实验空间。为此，作者采用实验设计（DoE）方法系统映射基因表达水平，并构建性能增强的生物传感器。该方法应用于响应木质素生物质分解产物原...

全细胞生物传感器 实验设计原儿茶酸咖啡酸剂量响应