ACS synthetic biology
2022
Hartline CJ, Zhang F
基于代谢物响应转录因子的代谢物生物传感器是合成生物学中用于感知和精确调控细胞代谢的关键元件。此类传感器通常在实验室条件下设计,但实际部署时细胞生长速率可能与初始表征差异很大。本文研究生长速率如何影响生物传感器的最低输出、最高输出和动态范围等关键性能指标。作者以大肠杆菌中 LacI、TetR 和 FadR 基生物传感器为模型,发现不同...
ACS synthetic biology
2022
Gong X, Zhang R, Wang J, Yan Y
转录因子在调控细胞功能中起关键作用。理解和改变基于转录因子的生物传感器的动态行为将扩展我们对生物分子相互作用的认识并促进生物合成应用。本研究在大肠杆菌中表征并工程化了一个基于 TrpR 的色氨酸阻遏系统。发现重建的 TrpR1-PtrpO1 生物传感器在色氨酸或其类似物 5-羟色氨酸(5-HTP)存在时表现出低基础表达和窄动态范围。...
Nucleic acids research
2020
Ding N, Yuan Z, Zhang X, Chen J 等 6 人
目前,基于转录因子(TF)的生物传感器难以通过预测性翻译调控获得期望输出。生物传感器系统的基因表达需具备适当的翻译强度,而核糖体结合位点(RBS)通过调节转录因子和报告基因的翻译水平,可微调其动态范围(诱导物存在与缺失时基因表达倍数变化)。然而,现有 TF 生物传感器普遍存在动态范围不可预测的问题。本文阐明了 RBS、翻译水平、蛋白...
ACS synthetic biology
2019
Dabirian Y, Li X, Chen Y, David F 等 6 人
代谢物生物传感器是高通量筛选和代谢通路动态调控的重要工具,其动态范围决定输出信号与背景噪声的区分能力。本研究以枯草芽孢杆菌 fapO/FapR 系统为例,在酿酒酵母中扩大基于转录因子生物传感器的最大动态范围。作者改造了五个天然启动子,包括组成型启动子和葡萄糖调控型启动子,并系统评估核心启动子中不同 fapO 结合位点位置对表达水平的...