Biosensors
2023
Zhang J, Gong X, Gan Q, Yan Y
植物天然产物(PNPs)具有多种药理活性,在全球市场具有巨大潜力。与传统植物提取和化学合成相比,微生物细胞工厂(MCFs)为高价值 PNPs 的合成提供了经济、可持续的替代途径。然而,异源合成通路通常缺乏天然调控系统,会给宿主细胞带来额外代谢负担。为克服这一挑战,生物传感器被开发并工程化,作为构建人工调控网络、根据环境信号控制酶表达...
Frontiers in bioengineering and biotechnology
2023
Tellechea-Luzardo J, Stiebritz MT, Carbonell P
合成生物学与基因工程的发展使基于生物元件的传感与调控需求日益增加。转录因子(TF)生物传感器可通过检测多种化学化合物并触发相应输出,是合成生物学中的有前景工具。然而,其广泛应用仍受限于代谢物激活型转录因子(aTF)知识库较小、新 aTF 鉴定方法不足以及新型生物传感器回路设计流程有待完善等问题。本文综述了当前关于 TF 生物传感器的...
Critical reviews in biotechnology
2023
Zhou S, Alper HS, Zhou J, Deng Y
过去数十年,基于细胞内生物传感器的动态调控策略在提高有用化合物产量方面取得显著进展。该方法可在维持最佳生长状态的同时实现高生产率。然而,工业发酵体系中同时存在高/低性能非遗传变异体以及不同生长阶段的年轻和衰老细胞,这种显著个体差异会阻碍在单细胞水平精确控制代谢通量,从而难以在宏观群体水平获得高生产率。细胞内生物传感器作为代谢网络的调...
Molecules (Basel, Switzerland)
2022
Wang S, Luo Y, Jiang W, Li X 等 6 人
为克服诱导剂添加和生物传感器等动态调控策略存在的毒性、成本与灵活性不足,本研究设计了一种光遗传双开关系统,用于提高聚羟基丁酸酯(PHB)产量。首先,通过优化核糖体结合位点(RBS),筛选出具有约10倍绿光激活与红光抑制动态范围的 RBS10–CcaS#10–CcaR 光感应/调控系统;随后,将其与经改造以降低串扰的蓝光激活 YF1–...
Current opinion in biotechnology
2022
微生物可将廉价可再生底物转化为高价值代谢物,但代谢通路优化仍受复杂生物学限制。遗传编码生物传感器可检测代谢物浓度或环境变化,并将输入转化为可测量或可执行输出,为复杂通路优化提供调控与监测工具。本文综述转录因子(TF)和核酸类生物传感器在代谢工程动态调控与高产菌株筛选中的最新进展。TF 传感器在配体结合后发生构象变化,调控启动子结合,...
Current opinion in biotechnology
2022
提高目标产物产量是构建和优化微生物细胞工厂的核心目标。赋予菌株基于生物传感器的智能,是解决代谢流不平衡、毒性中间体积累等工程问题的重要途径。近年来,通过理性设计、定向进化或机器学习,针对代谢物和环境信号的遗传编码生物传感器快速发展。除作为高通量筛选中的快速检测方法外,生物传感器越来越多地应用于菌株定向进化和代谢途径动态调控。本文综述...
ACS synthetic biology
2021
Ding N, Zhou S, Deng Y
转录因子型生物传感器(TFB)常用于代谢物检测、适应性进化与代谢通量调控。然而,面向合成生物学应用设计高性能 TFB 仍具挑战。天然 TFB 常因响应时间慢、动态范围、检测范围、灵敏度和选择性不匹配,难以满足实时检测需求;此外,复杂动态调控网络的设计与优化耗时费力。本综述重点介绍 TFB 在代谢物定量、高通量筛选、适应性进化和动态代...
Bioresource technology
2021
Xu Y, Wu Y, Lv X, Sun G 等 9 人
生物加工是一种基于生物催化的技术,已在工业制造中广泛应用,但低生物转化率、低生产力和高成本仍是主要限制。本文综述了近年来开发新型生物催化剂以应对上述挑战的策略。首先讨论蛋白质工程策略,包括定向进化、随机突变、定点突变、从头设计、融合伴侣、分泌表达和启动子工程等,用于提高酶的活性、稳定性、溶解度和表达水平。随后总结代谢工程策略,如基因...
FEMS yeast research
2019
Qiu C, Zhai H, Hou J
微生物细胞工厂可持续生产化学品、燃料和药物,但高通量检测产物合成仍费时费力,因为产物合成常无明确表型,传统分析难以快速评价菌株。遗传编码生物传感器可感知代谢物并将检测与执行器偶联,实现单细胞水平快速检测小分子,是高通量分析的有前景工具。本文综述酿酒酵母中生物传感器设计与工程化进展及其在代谢工程中的应用,介绍转录因子型、RNA型和酶耦...