mSystems
2019
Naydich AD, Nangle SN, Bues JJ, Trivedi D 等 10 人
将合成基因电路导入肠道细菌以感知、记录并响应体内信号，是诊断、治疗和预防疾病的新策略。然而，疾病响应电路的设计受限于已知生物传感器数量有限。本研究在大肠杆菌中应用稳健的遗传记忆电路，在健康与疾病哺乳动物肠道中鉴定新的细菌生物传感器触发器，用于构建诊断或治疗电路。作者建立了基于高通量文库构建、筛选、二代测序和计算分析的系统级流程，能够...
Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
2017
Bernard E, Wang B
细菌生活在不断变化环境中，为适应生理状态必须感知环境变化。当前对信号检测与处理机制及元件的理解，使我们能够利用一系列遗传元件处理环境信息。类似工程师使用电子元件构建电路，可重新连接细胞元件，构建数字逻辑和模拟基因电路，以编程方式使细胞对特定刺激产生设计行为。本文介绍设计和实现合成细胞基生物传感器的方法与协议，这些传感器利用工程化遗传...
ACS synthetic biology
2015
Didovyk A, Kanakov OI, Ivanchenko MV, Hasty J 等 6 人
本文提出一种由遗传工程微生物细胞群体构成的分布式分类器概念设计。其核心思想是用大量弱分类器或简单分类器组成复杂分类器：构建具有随机化合成生物传感器电路的主细胞群体，使其对作为输入向量的化学信号具有宽范围敏感性。随机敏感性通过在前端元件中引入随机控制序列（如核糖体结合位点，RBS）构建合成基因电路库实现。训练过程通过依次呈现正、负输入...