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Site-Specific mRNA Cleavage for Selective and Quantitative Profiling of Alternative Splicing with Label-Free Optical Biosensors.

Analytical chemistry 2019 Huertas CS, Bonnal S, Soler M, Escuela AM 等 6 人

mRNA前体替代剪接是基因调控关键过程,通过选择性包含外显子增加蛋白质组多样性;其异常与多数癌症相关,可作为癌症生物标志物。无标记光学生物传感器是核酸高灵敏、无标记分析的理想工具,但长链mRNA异构体因复杂长程碱基配对和高级结构导致直接检测困难。为此,作者提出一种从纯化总RNA生成长度受控RNA片段的方法,便于生物传感器检测。该方法...

表面等离子共振(SPR)生物传感器 替代剪接mRNA异构体RNase H切割无标记检测

Quantitative evaluation of alternatively spliced mRNA isoforms by label-free real-time plasmonic sensing.

Biosensors & bioelectronics 2016 Huertas CS, Carrascosa LG, Bonnal S, Valcárcel J 等 5 人

mRNA前体替代剪接使细胞根据发育或稳态状态从同一基因产生不同蛋白产物,其失调与疾病发生和进展密切相关。现有替代剪接监测方法程序复杂,且常因交叉杂交而难以区分密切相关的异构体。本文报道一种基于表面等离子共振(SPR)生物传感器的通用方法,可无标记、实时监测替代剪接事件,无需cDNA合成或PCR扩增。作者将该方法应用于HeLa细胞RN...

表面等离子共振(SPR)生物传感器 替代剪接mRNA异构体无标记检测Fas/BCL-X