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Quantitative comparison between sub-millisecond time resolution single-molecule FRET measurements and 10-second molecular simulations of a biosensor protein.

PLoS computational biology 2020 Girodat D, Pati AK, Terry DS, Blanchard SC 等 5 人

分子动力学(MD)模拟旨在以实验相关时间分辨率提供构象动态生物系统的原子级洞察,但模拟时间尺度与单分子荧光测量时间分辨率的限制使二者难以在重叠时间域内定量比较。本文报道了与体外单分子 Förster(荧光)共振能量转移(smFRET)测量时间尺度重叠的氨基酸结合蛋白 LIV-BPSS 的 MD 模拟,时间分辨率达亚毫秒。研究采用经显...