Biofilm formation by
金黄色葡萄球菌形成由胞外基质维系的多细胞生物膜，基质主要由胞质蛋白和胞外DNA组成。这些生物膜在感染或含葡萄糖培养基中组装，但触发生物膜形成的细胞内信号及其下游靶点未知。本文提供证据表明，生物膜形成由第二信使环二腺苷酸（cyclic-di-AMP, c-di-AMP）水平下降触发。先前研究鉴定了胞外DNA释放所需基因，包括c-di-...
Identification of novel genetic factors that regulate c-di-AMP production in
核苷酸第二信使使细菌快速响应环境变化。环二腺苷酸（c-di-AMP）是金黄色葡萄球菌生长所必需的第二信使，参与钾离子、渗透压溶质摄取及β-内酰胺抗性调控。其胞内浓度主要由合成酶DacA和水解酶GdpP决定，但其他调控因子有限。本研究构建由枯草芽孢杆菌kimA c-di-AMP结合核糖开关与yfp报告基因组成的荧光生物传感器，用于检测...
Modeling a synthetic aptamer-based riboswitch biosensor sensitive to low hexahydro-1,3,5-trinitro-1,3,5-triazine (RDX) concentrations.
RNA适配体是较短的核酸序列，可高亲和性结合靶标；当与能够启动荧光报告蛋白翻译的核糖开关组合时，可用于多种介质中的化学检测。该过程从分子尺度的靶标结合延伸到宏观尺度的荧光检测，涉及多个限速的物理变化（如分子构象变化）和生化变化（如反应速率），使检测设计复杂。本文描述了一个用于辅助环境检测六氢-1,3,5-三硝基-1,3,5-三嗪（R...
Integrating and amplifying signal from riboswitch biosensors.
生物传感器具有内置能量供应和固有识别机制，若合理利用可能超越传统传感器。然而，现有生物传感器存在配体检测范围窄、信号输出较低以及难以整合多路信号等限制。信号整合可提高传感器特异性，并允许同时检测多种配体组合，从而指示环境或发育过程；信号放大则可提高检测灵敏度和检测范围。核糖开关有望扩大可检测配体的多样性，而合成生物学的发展为基于正交...