合成生物学与代谢工程使微生物细胞工厂能够生产燃料、化学品和药物，但代谢物浓度相关表型的测量与精确控制仍是瓶颈。遗传编码小分子生物传感器可将代谢物浓度与可测量或可执行输出相耦合，是解决该瓶颈的重要工具。本文综述了代谢工程中小分子生物传感器的设计、优化与应用，重点讨论转录因子（TF）型传感器的优化策略。围绕中心法则，遗传编码小分子传感器...
组合合成代谢通路的设计能力已远超对所得微生物菌株进行高效筛选与选择的能力，因此高通量快速筛选技术对合成生物学和代谢工程至关重要。本文报道了一种基于 RNA 核糖开关、带有双荧光报告模块的生物传感器，并建立了基于流式细胞术的高通量筛选方法，用于在共培养体系中鉴定柚皮素（naringenin）高产大肠杆菌菌株。研究确定了影响传感器性能的...
核糖开关是主要存在于细菌中的基因调控单元，能够响应小分子配体并改变基因表达。这类结构化 RNA 由适配体结构域和表达平台组成：前者高特异性、高亲和力结合目标配体，后者将配体结合事件转导为基因表达输出。近年来，研究者通过理性突变、结构引导设计、筛选与计算建模等方法，开发了可识别新型小分子诱导物的适配体结构域，并优化了表达平台，使其能与...
核糖开关是一类 RNA 传感器，通过 mRNA 5' 非翻译区在化学诱导下发生结构变化来调控下游基因表达。将特定核糖开关与报告基因系统偶联，可将细胞对化学物的检测转化为可量化的报告蛋白信号。然而多数报告系统仅在目标分析物存在时产生信号，难以判断未诱导生物传感器在真实应用中的活性和定位。为此，作者开发了基于大肠杆菌菌毛相变系统的双色报...
本报告总结了2016年6月24日至25日在波尔多举行的‘Aptamers in Bordeaux’研讨会。会议围绕适配体的体外选择、结构表征及其在分析、诊断和治疗中的应用展开，涵盖天然与人工核糖开关、RNA调控机制、突变聚合酶和化学修饰核苷酸碱基赋予适配体新功能的最新进展。报告还介绍了适配体平台在多种重大疾病生物标志物多路复用分析中...