In Vivo Detection of Cyclic-di-AMP in
环二腺苷酸（cyclic-di-AMP, CDA）是金黄色葡萄球菌（Staphylococcus aureus）中调控抗生素耐受、渗透调节、生物膜形成和毒力等多种细胞功能的重要第二信使。准确测定活菌内 CDA 浓度对理解其耐药机制和临床监测具有重要意义。本研究开发了一种新型 RNA 荧光生物传感器 bsuO P6-4，用于在金黄色葡...
Incorporation of a FRET Pair into a Riboswitch RNA to Measure Mg
核糖开关是能够感知小分子并调控基因表达的天然生物传感器，其结构动态对阐明调控机制和开发 RNA 生物传感器至关重要。本研究将荧光团 Cy3 及其淬灭剂 TQ3 通过位点选择性 RNA 标记（PLOR）和偶联反应，分别掺入全长腺嘌呤核糖开关 RNA 及其适配体结构域，用于在体外和细胞内监测 RNA 构象动态。结果表明，腺嘌呤核糖开关对...
The Signaling Pathway That cGAMP Riboswitches Found: Analysis and Application of Riboswitches to Study cGAMP Signaling in
本研究围绕 Geobacter sulfurreducens 中 cGAMP 信号通路，发展了基于亲和捕获与测序的方法，用于鉴定可结合 cGAMP 等非编码 RNA 区域。作者将 cGAMP 偶联到 Sepharose 微珠上，对脱硫弧菌转录组进行亲和捕获，并对捕获产物进行 RNA-seq 分析；结果显示，尽管体外实验中 cGAMP...