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Ranking Single Fluorescent Protein-Based Calcium Biosensor Performance by Molecular Dynamics Simulations.

Journal of chemical information and modeling 2025 Berksoz M, Atilgan C

遗传编码荧光生物传感器(GEFB)已成为在活体内可视化生物过程的重要工具。典型 GEFB 由感受域(SD)与荧光蛋白(FP)基因融合组成,SD 结合配体或发生酶促反应后构象改变,变构调节色酚环境并改变光谱性质。单荧光蛋白型传感器实验设置简单、单波长操作、易于在活细胞中表达且结构稳定,但 FP 与 SD 之间连接链的长度和残基组成显著...

Distal Hydrogen-bonding Interactions in Ligand Sensing and Signaling by Mycobacterium tuberculosis DosS.

The Journal of biological chemistry 2016 Basudhar D, Madrona Y, Yukl ET, Sivaramakrishnan S 等 7 人

结核分枝杆菌 DosS 是响应一氧化氮(NO)、一氧化碳(CO)或缺氧而诱导休眠基因的关键组氨酸激酶。这些环境刺激由 DosS 血红素基团感知,引起 DosS 组氨酸残基自磷酸化,随后将磷酸基团转移至响应调节子 DosR 的天冬氨酸残基。为阐明气态配体识别与信号转导机制,作者通过定点突变 Glu-87 和 His-89,研究铁结合 ...