Synthetic and systems biotechnology
2024
Yang X, Wang H, Ding D, Fang H 等 6 人
遗传编码回路已成功用于从大型突变库中评估和表征具有理想性状的靶标变体。腺苷钴胺素(AdoCbl)是多种胞内生理反应必需的辅酶,广泛应用于医药和食品工业。能够检测 AdoCbl 产量并筛选优良合成菌株的高通量筛选技术,对构建工业化微生物细胞工厂至关重要。本研究开发了一种 RNA–蛋白混合生物传感器:输入部分为内源 RNA 核糖开关,特...
Bioprocess and biosystems engineering
2021
大肠杆菌中 L-色氨酸(L-Trp)生产长期依赖随机诱变与筛选,但所得菌株遗传背景不清。本研究将细胞内 L-Trp 生物传感器与流式细胞分选(FACS)结合,在大肠杆菌中筛选获得 L-Trp 高产株 TPD5,并系统阐明其过量生产的遗传基础。全基因组测序鉴定出多个突变,其中影响最显著的正向突变包括 TnaA 缺失、AroG S211...
Nature communications
2020
Bennett NK, Nguyen MK, Darch MA, Nakaoka HJ 等 13 人
能量代谢紊乱是细胞功能障碍和多种疾病的重要驱动因素,但增加或维持细胞内三磷酸腺苷(ATP)水平的方法仍缺乏。为绘制调控细胞ATP的基因与通路全景图谱——ATPome,作者将全基因组CRISPR干扰/激活筛选与ATP生物传感器相结合,在呼吸、糖酵解和基础三种代谢条件下系统鉴定ATP调控基因。结果显示,ATP水平可通过促进能量生成或抑制...
Metabolic engineering
2020
假单胞菌 Pseudomonas putida KT2440 因可将多种碳源转化为顺,顺-粘康酸等产物而受到关注。此前工程菌株可从葡萄糖生产粘康酸,但周质葡萄糖氧化导致大量 2-酮葡萄糖酸积累,降低产物收率与选择性。删除葡萄糖脱氢酶基因 gcd 可避免 2-酮葡萄糖酸积累,却显著减慢生长和粘康酸生产。本研究采用适应性实验室进化改善不...
PLoS biology
2018
Mendelsohn BA, Bennett NK, Darch MA, Yu K 等 13 人
能量代谢不足或失调可能参与多种遗传性、退行性疾病、癌症甚至衰老。ATP 是细胞中央能量载体,但调控 ATP 水平的关键通路尚未系统阐明。作者将富集线粒体基因的池化 CRISPRi 文库、荧光生物传感器和流式细胞分选(FACS)结合,建立高通量遗传筛选,用于检测活人细胞中 ATP 浓度。该策略鉴定出此前未知参与能量代谢的基因。多数线粒...
Applied microbiology and biotechnology
2018
Zhang X, Zhang X, Xu G, Zhang X 等 6 人
L-丝氨酸广泛用于医药、食品和化妆品工业。虽然谷氨酸棒杆菌可从糖直接发酵生产 L-丝氨酸,但产量仍较低。本研究以工程菌 C. glutamicum ΔSSAAI 为出发菌株,采用大气压室温等离子体(ARTP)诱变提高 L-丝氨酸产量,并基于特异性响应 L-丝氨酸的转录因子 NCgl0581 构建新型荧光生物传感器,通过荧光激活细胞分...
Journal of biotechnology
2017
Schulte J, Baumgart M, Bott M
环磷酸腺苷(cAMP)在许多物种中作为第二信使发挥调控作用。在工业模式菌谷氨酸棒杆菌中,cAMP是全局转录调控因子GlxR的效应物,cAMP-GlxR复合物可激活或抑制约200个靶基因表达。膜结合III类腺苷酸环化酶CyaB由ATP合成cAMP,但菌内可能还存在未知cAMP合成酶;近期已鉴定cAMP磷酸二酯酶CpdA,可催化cAMP...