Nucleic acids research
2016
Jha RK, Kern TL, Kim Y, Tesar C 等 7 人
全细胞生物传感器利用转录因子(TF)可灵敏、选择性地检测特殊化学品或人为分子,但需要更多可用的 TF。本研究基于同源建模和配体对接识别结合口袋,并通过保守突变工程化 Acinetobacter 转录因子 PobR,使其能够识别对硝基酚(pNP),并通过 PobR 启动子驱动的荧光蛋白报告基因测量响应。在约 10^7 个 PobR 变...
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
2016
Rogers JK, Church GM
工程细胞生产高价值代谢产物受限于缓慢且费力的浓度评估方法,许多设计未被评估,产物形成动力学也未被观察。本文建立一种无需样品制备和复杂分析即可实时观察产物形成的框架。利用源自小分子响应转录因子的遗传编码生物传感器,提供与细胞内目标代谢物浓度成正比的荧光读出。将合适传感器与产物合成细胞组合,可通过荧光追踪产物形成;单个细胞荧光强度与其代...
ACS synthetic biology
2016
David F, Nielsen J, Siewers V
在微生物宿主中建立异源合成途径以高滴度和高收率生产工业化学品,需要高效调整中心碳代谢,使代谢通量导向目标产物。这可通过对代谢网络关键分支点的调控实现。本文提出一种围绕关键中间物丙二酰辅酶A(malonyl-CoA)的层级动态控制新方法,用于动态调节途径通量和酶表达水平。控制系统的上层通过下调 malonyl-CoA 用于脂肪酸合成的...
Metabolic engineering
2016
Fang M, Wang T, Zhang C, Bai J 等 8 人
由于通路工程方法通常缺乏高通量筛选工具,我们开发了一种名为中间物传感器辅助推拉策略(InterSPPS)的新策略,通过引入靶向关键通路中间物的生物传感器实现通路顺序优化。作为概念验证,我们构建了 L-色氨酸(L-Trp)生物传感器,并用于优化脱氧紫罗兰素(deoxyviolacein)生物合成通路;该通路被分为两个模块,L-Trp ...