pH-dependent absorption spectra of rhodopsin mutant E113Q: On the role of counterions and protein.

本文采用量子力学/分子力学（QM/MM）混合方法，在分子水平研究了牛视紫红质突变体E113Q在不同pH溶液中的吸收光谱。基于X射线结构建立模型，经分子动力学平衡、ONIOM几何优化和SORCI+Q激发能计算，分析席夫碱质子化（PSB）与去质子化（SB）状态、水分子氢键网络以及Cl-、Na+等反离子的作用。结果表明，E113Q中席夫碱...