2 条结果 关键词:计算机辅助设计 ×

Advances in ligand-specific biosensing for structurally similar molecules.

Cell systems 2023 Xi C, Diao J, Moon TS

生物系统的特异性使研究者能够在复杂医学或环境样品中开发针对特定代谢物、毒素和污染物的生物传感器,而不受结构类似化合物的干扰。过去二十年,合成生物学策略被广泛用于创造具有新功能的蛋白质或核酸。除增强生物催化活性、扩大底物范围以及提高酶的立体选择性和稳定性外,增强遗传编码生物传感器的分子特异性已成为重要研究方向。本文综述了高特异性生物传...

Computer-aided design of aptamers for cytochrome p450.

Journal of structural biology 2015 Shcherbinin DS, Gnedenko OV, Khmeleva SA, Usanov SA 等 12 人

适配体是具有稳定空间结构、可高亲和力和特异性结合靶标的短单链 DNA 或 RNA 寡核苷酸,通常通过 SELEX 实验筛选。本文提出一种用于蛋白靶标的计算机辅助适配体设计方法,包括三步:首先通过分子对接和结构分析寻找潜在结合位点;其次分别设计负责靶标识别的短序列和维持识别区构象的结构部分;最后通过分子动力学模拟和 MM–PBSA/N...