精确工程化植物转录调控对基础研究和应用都至关重要。天然启动子受进化限制，模块化、可调性和可预测性不足。合成启动子由明确顺式调控元件组成，可招募基因特异性转录因子和通用转录机器，实现精细转录控制。本综述系统总结植物合成启动子的设计与应用，涵盖核心、近端和远端启动子结构，以及启动子语法（基序身份、与转录起始位点距离、间距、螺旋相位、方向...
微生物在自然生态位中暴露于多种信号分子，特异性识别这些信号会改变其代谢与生理状态。生长素如吲哚-3-乙酸（IAA）是调控植物生长发育的关键植物激素，但生长素合成并不局限于植物，而广泛存在于所有生命界。生长素生产的广泛系统发育分布及其调控细胞过程的多样性，使其成为生命体内重要的界内与界间信号分子，可调控微生物生理、代谢和毒力等。尽管生...
SlyA 是沙门氏菌和大肠杆菌中调控毒力基因及表面组分表达的反沉默转录因子，主要通过拮抗 H-NS 抑制子发挥作用。此前报道 ppGpp 可促进 SlyA 二聚化并增强其在 pagC 启动子的 DNA 结合，从而上调该基因表达；而实时监测活菌内 ppGpp 水平一直是 stringent response 领域的难题。作者因此设想 ...
监测细胞行为并适时调控细胞过程，是应对当前代谢工程复杂性的关键。转录生物传感器有望增强并加速现有代谢工程策略，推动工业生物技术的重要进展。此类传感器的开发通常始于对自然界丰富调控元件的挖掘。本文首先简要讨论转录生物传感器的基本架构与多种作用机制，并介绍用于搜索天然转录因子及其结合位点的实验方法、计算方法和相关本体资源。随后，本文综述...
OxyR 通过可逆还原的半胱氨酸二硫键生物传感器感知细胞氧化还原状态，转录调控大肠杆菌氧化应激响应基因。氧化还原变化引起的构象改变传递至二聚体亚基界面，改变二聚体与四聚体同 DNA 的相互作用。与大肠杆菌 OxyR 调节结构域不同，牙龈卟啉单胞菌 OxyR 调节结构域在二硫键氧化/还原状态下二聚体构象差异极小，其锁定构象与大肠杆菌氧...