Validation and calibration of a novel GEM biosensor for specific detection of Cd

BMC biotechnology 2023 Herath HMLPB, de Silva WRM, Dassanayake RS, Gunawardene YINS 等 8 人

本研究设计一种新型遗传电路，模拟铜绿假单胞菌 CadA/CadR 操纵子介导的重金属稳态机制，将天然操纵子中的 DNA 元件重新组合，并与增强型绿色荧光蛋白 eGFP 报告基因偶联，构建基础 NOT 型逻辑门 CadA/CadR-eGFP，以响应 Cd2+、Zn2+ 和 Pb2+。将化学合成的 CadA/CadR-eGFP 基因电路...

全细胞生物传感器 基因工程微生物重金属检测镉铅锌eGFP报告基因

Algorithmic Programming of Sequential Logic and Genetic Circuits for Recording Biochemical Concentration in a Probiotic Bacterium.

ACS synthetic biology 2023 Lebovich M, Zeng M, Andrews LB

本文提出一种可扩展的计算方法，用于在益生菌大肠杆菌 Nissle 1917（EcN）中设计稳健的顺序逻辑遗传电路。工程益生菌可作为胃肠道无创诊断工具，但活细胞需在离开肠道后仍能报告曾检测到的生物标志物或信号，因此遗传电路必须具备遗传编码记忆。此前含记忆的顺序逻辑电路已在模式大肠杆菌中建立，但其在非模式、临床相关菌株中的元件性能变化尚...

全细胞生物传感器 遗传电路益生菌顺序逻辑浓度记录

Engineered Bacteria for Short-Chain-Fatty-Acid-Repressed Expression of Biotherapeutic Molecules.

Microbiology spectrum 2023 Serebrinsky-Duek K, Barra M, Danino T, Garrido D

短链脂肪酸（SCFA）如丙酸和丁酸是肠道菌群产生的关键代谢物，其浓度改变与炎症性肠病（IBD）等疾病相关。本研究构建了可感知 SCFA 浓度的遗传电路，用于开发能表达响应蛋白（超折叠绿色荧光蛋白，sfGFP）的生物传感器，其表达量与 SCFA 浓度呈反比。作者利用丙酸响应启动子 PprpB 和丁酸响应启动子 PpchA，通过 NOT...

全细胞生物传感器 短链脂肪酸遗传电路NOT逻辑GM-CSF