International journal of molecular sciences
2020
溶菌酶是研究蛋白质结构与功能关系的经典模型蛋白,近期也被用于加速以细菌为主的二级污泥降解,但针对溶菌酶工程化的高通量筛选系统尚未见报道。本文建立了一种基于遗传编码生物传感器的T4溶菌酶(T4L)筛选系统。作者将T4L基因克隆至araBAD启动子(PBAD)控制的质粒中,并在大肠杆菌DH5α中实现可溶性表达,且未对细胞生长产生毒性。进...
The Plant cell
2020
Hõrak H
电子载体烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(NAD)及其磷酸化形式 NADP 通过还原型 NAD(P)H 与氧化型 NAD(P)+ 的相互转化介导细胞代谢中的氧化还原反应。NAD 水平改变会影响植物发育和胁迫响应,但植物体内缺乏实时监测 NAD 池大小及还原/氧化比值的技术。本文简报介绍了 Steinbeck 等将 pH 不敏感的遗传编码荧光生物...
International journal of molecular sciences
2020
Henke NA, Austermeier S, Grothaus IL, Götker S 等 7 人
谷氨酸棒杆菌类胡萝卜素合成受 MarR 型调控子 CrtR 控制,CrtR 抑制 crt 操纵子启动子 PcrtE 和自身基因 PcrtR 转录。GGPP 及其他异戊二烯焦磷酸在体外干扰 CrtR 与靶 DNA 结合,提示其为诱导物。为判断该功能在放线菌中是否保守,作者表征了五个 CrtR 同源物。EMSA 显示 C. callun...
Trends in biochemical sciences
2020
Zhou X, Mehta S, Zhang J
细胞信号网络在时间和空间上受到精细调控,决定细胞对不同刺激的响应与命运。遗传编码的荧光和生物发光生物传感器能够在天然生物学环境中直接可视化这些时空信号动态,已成为强有力的分子工具。本文首先回顾生物传感器设计的基本原理,并评述加速传感器开发的新近技术,包括新型传感单元、报告单元和高通量筛选策略。随后重点讨论遗传编码荧光与生物发光生物传...
The international journal of biochemistry & cell biology
2020
Moeyaert B, Dedecker P
遗传编码生物传感器是可视化活细胞内外分析物或生物学过程时空动态不可或缺的工具。过去二十余年,随着面向新分析物或新过程的传感器不断开发,其功能、稳健性和应用范围持续提升。本综述重点介绍遗传编码生物传感器设计中的近期进展,尤其关注新颖且创新的支架,这些支架有望为未来传感与成像开辟新的可能性。文章首先概述传感域与报告域的基本设计原则,包括...
Biotechnology journal
2020
Marsafari M, Samizadeh H, Rabiei B, Mehrabi A 等 6 人
黄酮类化合物是一类源自苯丙烷类代谢的植物次生代谢物,广泛存在于水果、蔬菜和药用植物中,具有抗肥胖、抗癌、抗炎和抗糖尿病等生物活性。其低生物利用度限制了应用,而植物提取和化学合成在安全性、经济性和规模化方面存在瓶颈。本文综述了黄酮类化合物生物制造的最新进展,重点总结植物代谢工程、微生物宿主选择以及遗传编码生物传感器。植物代谢工程可通过...
ACS synthetic biology
2020
Thompson MG, Pearson AN, Barajas JF, Cruz-Morales P 等 13 人
己内酰胺是尼龙6的重要聚合物前体,目前主要源自石油,年产量约500万吨。现有生物合成途径效率低,产量通常不超过2 mg/L,亟需开发新途径。由于新代谢途径开发常需大量设计且产物滴度低,高灵敏度的终产物生物传感器可显著加速筛选。本文报道了来自 Pseudomonas putida KT2440 的 OplR(PP_3516)戊内酰胺/...
Metabolic engineering
2020
氨基酸发酵是工业生物技术的重要支柱,全球氨基酸市场持续扩大并不断多元化。代谢工程已不再仅聚焦于百万吨级大宗氨基酸 L-谷氨酸和 L-赖氨酸的菌株开发,而是转向特种氨基酸的生产。为满足这一需求,研究者开发并应用了包括 CRISPR 基因编辑/干扰、遗传编码生物传感器以及灵活底物利用、共生产和共培养在内的新工具与工艺。本文以特种蛋白源氨...