4 条结果 关键词:CRISPRi ×

Biosensor-assisted CRISPRi high-throughput screening to identify genetic targets in

Synthetic and systems biotechnology 2024 Peng Q, Bao W, Geng B, Yang S

乳酸是合成聚乳酸(PLA)的重要单体,也是替代石化塑料的关键原料。为获得高滴度、高速率和高产率的乳酸生产菌株,需要高效乳酸合成途径及影响乳酸生产与耐受性的遗传靶点。本研究首先将基于 LldR 的 D-乳酸生物传感器应用于 Zymomonas mobilis,通过筛选强 GFP 荧光突变株,获得 D-乳酸产量可能增加的菌株。随后,将该...

Biosensor-assisted titratable CRISPRi high-throughput (BATCH) screening for over-production phenotypes.

Metabolic engineering 2023

随着代谢途径和合成生物学工具快速发展,微生物生物制造中如何最优重连代谢通量并加速高通量表型筛选仍是挑战。本文建立了生物传感器辅助可滴定 CRISPRi 高通量(BATCH)筛选方法,将可滴定错配 CRISPR 干扰与生物传感器介导的高产表型筛选结合,用于大肠杆菌。作者首先开发可编程错配 CRISPRi,通过单管 sgRNA 池(每个...

Identification of acetic acid sensitive strains through biosensor-based screening of a Saccharomyces cerevisiae CRISPRi library.

Microbial cell factories 2022 Mormino M, Lenitz I, Siewers V, Nygård Y

乙酸耐受对利用含高浓度乙酸的木质纤维素水解物构建稳健细胞工厂至关重要。本研究基于酿酒酵母内源转录因子 Haa1 构建乙酸生物传感器,用于筛选 CRISPRi 酵母菌株库;该库中 dCas9-Mxi 分别抑制每个必需或呼吸生长必需基因。通过流式细胞分选富集了乙酸保留更高的细胞群体,并证明这些高生物传感器信号细胞对乙酸更敏感。基于生物传...

荧光生物传感器 乙酸酿酒酵母CRISPRi筛选

A high-throughput screen of real-time ATP levels in individual cells reveals mechanisms of energy failure.

PLoS biology 2018 Mendelsohn BA, Bennett NK, Darch MA, Yu K 等 13 人

能量代谢不足或失调可能参与多种遗传性、退行性疾病、癌症甚至衰老。ATP 是细胞中央能量载体,但调控 ATP 水平的关键通路尚未系统阐明。作者将富集线粒体基因的池化 CRISPRi 文库、荧光生物传感器和流式细胞分选(FACS)结合,建立高通量遗传筛选,用于检测活人细胞中 ATP 浓度。该策略鉴定出此前未知参与能量代谢的基因。多数线粒...