Classification of Epigenetic Biomarkers with Atomically Thin Nanopores.
本文利用二维固态纳米孔材料的电子特性，结合全原子分子动力学模拟、纳米器件模拟和统计信号处理算法，提出一种通用且可广泛应用的生物传感技术。作为案例研究，作者探索对结合在双链DNA上的三种表观遗传生物标志物进行分类：甲基-CpG结合域蛋白1（MBD-1）、甲基CpG结合蛋白2（MeCP2）和γ-环糊精（GCD），以识别DNA上的高甲基化...
An electrochemical strategy with tetrahedron rolling circle amplification for ultrasensitive detection of DNA methylation.
基因组DNA中DNA甲基化的灵敏、特异检测对快速表观遗传评估至关重要。本文开发了一种新型灵敏电化学策略，通过锁探针引物生成滚动环扩增（RCA）实现基因组DNA中DNA甲基化的超灵敏检测。通常，甲基化DNA经亚硫酸氢盐处理后，甲基化特异性线性锁探针仅在甲基化DNA存在时环化，并作为含有DNA四面体的RCA模板。DNA四面体作为纳米载体...
Label-free DNA-methylation detection by direct ds-DNA fragment screening using poly-purine hairpins.
癌症诊断因对肿瘤发生机制的理解不断深入而持续演进，DNA甲基化已成为癌症预后和诊断的有效生物标志物，尤其适用于原发部位不明肿瘤。该表观遗传机制的可逆性也使其成为开发精准个性化治疗的重要工具。现有亚硫酸氢盐转化或PCR扩增等方法步骤复杂，难以标准化。本文提出一种基于表面等离子共振（SPR）的光学生物传感器方法，采用多嘌呤反向Hoogs...
Rapid Electrochemical Assessment of Tumor Suppressor Gene Methylations in Raw Human Serum and Tumor Cells and Tissues Using Immunomagnetic Beads and Selective DNA Hybridization.
本文报道一种快速、灵敏的电化学策略，用于检测基因特异性5-甲基胞嘧啶（5-mC）DNA甲基化。以抗5-mC单克隆抗体修饰羧基磁性微球（HOOC-MBs），选择性捕获任意含5-mC的甲基化单链DNA；随后用生物素化DNA探针与捕获序列甲基化区侧翼区杂交，并标记链霉亲和素-辣根过氧化物酶（Strep-HRP）。在一次性碳印刷电极（SPC...