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A DNA-Based Biosensor Assay for the Kinetic Characterization of Ion-Dependent Aptamer Folding and Protein Binding.

Molecules (Basel, Switzerland) 2019 Ponzo I, Möller FM, Daub H, Matscheko N

治疗与诊断用核酸适配体被设计为高亲和、高特异结合靶标。适配体相互作用的结构与动力学分析日益重要。本文报道一种基于 switchSENSE 的荧光适配体传感器,用于详细表征适配体–分析物相互作用及适配体折叠,以凝血酶结合适配体(TBA)为模型体系。TBA 折叠为 G-四联体及其与凝血酶的结合强烈依赖溶液中离子的种类和浓度。作者实时观察...

An ultrasensitive and simple fluorescence biosensor for detection of the Kras wild type by using the three-way DNA junction-driven catalyzed hairpin assembly strategy.

The Analyst 2019 Li Q, Zhou D, Pan J, Liu Z 等 5 人

本文提出一种无标记荧光生物传感器,用于基于三叉DNA连接驱动催化发夹组装策略简单检测Kras野生型。体系中设计了由DNA链S1和S2与靶标共同形成的三叉DNA连接探针(JP),以及两个发夹探针H1和H2。当存在Kras野生型时,JP可激活自催化DNA机器,引发催化发夹组装,产生大量游离G-rich序列;这些序列与荧光染料N-甲基原卟...

Amplification-free and direct fluorometric determination of telomerase activity in cell lysates using chimeric DNA-templated silver nanoclusters.

Mikrochimica acta 2019 Lee ST, Rahman R, Muthoosamy K, Mohamed NAH 等 7 人

本文开发了一种基于嵌合 DNA 模板银纳米簇(AgNCs)的荧光探针,用于直接测定癌细胞裂解液中的端粒酶活性。研究比较了端粒酶延伸反应前(路线 A)和反应后(路线 B)形成 AgNCs 的两种策略,发现端粒酶阳性样品中 AgNCs 的黄色荧光发射(最佳激发/发射波长 470/557 nm)发生选择性猝灭。利用合成延伸 DNA 模拟端...

Label-free optical biosensor for target detection based on simulation-assisted catalyzed hairpin assembly.

Computational biology and chemistry 2019 Zhang Y, Wang L, Wang Y, Dong Y

针对小分子/生物活性分子检测中酶促反应和复杂纳米材料依赖的问题,本文利用血栓素适配体的高亲和识别能力和催化发夹组装(CHA)的无酶等温放大特性,建立了一种无标记、无酶的光学放大检测策略用于血栓素检测。为同时支持生物学探究与技术优化,作者引入热力学模型预测相互作用核酸链的最低自由能二级结构,并计算体系配分函数与复合物平衡浓度;随后对相...