Understanding the self-assembly dynamics of A/T absent 'four-way DNA junctions with sticky ends' at altered physiological conditions through molecular dynamics simulations.

本文旨在阐明DNA分支等替代高阶结构的结构与动力学，以服务于治疗设计。作者报道了一种不含A/T碱基、带粘性末端的四路DNA连接体，其序列为d(CGGCGGCCGC)4，可在不同人工生理条件下自组装成四路连接体构象。研究以晶体结构坐标（PDB ID: 3Q5C）为初始模型，在DESMOND软件中采用OPLS-2005力场，对不同温度和...