Nanopore-Aware Embedded Detection for Mobile DNA Sequencing: A Viterbi-HMM Design Versus Deep Learning Approaches.

基于纳米孔的 DNA 测序可在紧凑移动平台中实现实时分子诊断，但碱基识别（basecalling）将原始纳米孔电流信号转换为核苷酸序列的过程计算复杂，功耗高。深度学习碱基识别器精度高，但需要大量计算资源，不适合便携式生物传感器。本文提出一种嵌入式硬件-软件框架，在定制 64 位 RISC-V 核上实现基于 Viterbi 的隐马尔可...