Computation-guided transcription factor biosensor specificity engineering for adipic acid detection.

Computational and structural biotechnology journal 2024 Pham C, Stogios PJ, Savchenko A, Mahadevan R

基于转录因子（TF）的小分子生物传感器可将配体识别与荧光等读出相偶联，是合成生物学中有用的工具，但可用于目标分子的已表征 TF 有限。本研究提出一种基于分子对接的计算工作流，用于定向改变 TF 的配体特异性。作者以 LysR 家族 TF BenM 为对象，通过计算筛选获得单个氨基酸替代位点，将其天然配体 cis,cis-粘康酸（CC...

荧光生物传感器 转录因子生物传感器己二酸cis,cis-粘康酸分子对接

Design, Engineering, and Characterization of Prokaryotic Ligand-Binding Transcriptional Activators as Biosensors in Yeast.

Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) 2018 Ambri F, Snoek T, Skjoedt ML, Jensen MK 等 5 人

在细胞工厂开发中，筛选步骤常依赖低通量分析方法，落后于多样性构建方法，使最优细胞工厂设计的鉴定与选择耗时且昂贵，制约制造过程。在酿酒酵母中，将原核生物别构调控转录因子作为代谢物生物传感器，是缓解该筛选瓶颈的有效策略。本文提供在酿酒酵母中筛选并整合原核转录激活因子作为代谢物生物传感器的方案。以 LysR 型转录调控因子（LTTR）家族...

全细胞生物传感器 转录因子酿酒酵母cis,cis-粘康酸流式细胞术