Recent Development in Biomedical Applications of Oligonucleotides with Triplex-Forming Ability.

Polymers 2023 Bekkouche I, Shishonin AY, Vetcher AA

三链DNA是由三条寡核苷酸链相互缠绕形成的三螺旋结构（TFO）。在特定条件下，第三链可通过Hoogsteen碱基配对结合到RNA、PNA或DNA上，形成三链核酸。此类寡核苷酸可作为锚定元件，与特定生物活性分子偶联，或作为信使，通过三链形成区在转录与复制之间进行切换。由于多种疾病与三链易形成序列的扩增相关，本文还讨论了相关数据。结合代...

综述或非传感器论文 三链DNA三链形成寡核苷酸适配体核酸生物传感器

Understanding the self-assembly dynamics of A/T absent 'four-way DNA junctions with sticky ends' at altered physiological conditions through molecular dynamics simulations.

PloS one 2023 Singh A, Yadav RK, Shati A, Kamboj NK 等 8 人

本文旨在阐明DNA分支等替代高阶结构的结构与动力学，以服务于治疗设计。作者报道了一种不含A/T碱基、带粘性末端的四路DNA连接体，其序列为d(CGGCGGCCGC)4，可在不同人工生理条件下自组装成四路连接体构象。研究以晶体结构坐标（PDB ID: 3Q5C）为初始模型，在DESMOND软件中采用OPLS-2005力场，对不同温度和...

综述或非传感器论文 DNA四路连接体Holliday junction分子动力学模拟温度响应