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End-to-end computational approach to the design of RNA biosensors for detecting miRNA biomarkers of cervical cancer.

Synthetic and systems biotechnology 2022 Baabu PRS, Srinivasan S, Nagarajan S, Muthamilselvan S 等 7 人

宫颈癌是严重威胁育龄女性健康的全球公共卫生问题,也是全球癌症患者中第二大疾病负担,死亡率高达50%。由于公众认知不足和有效诊断手段有限,亟需开发即时、微创的诊断方法。本文建立了一套端到端、定量的统一计算诊断流程,依次完成最优生物标志物识别、toehold switch 传感器同步设计以及诊断基因电路的性能模拟。基于公开 miRNA ...

Toward Mail-in-Sensors for SARS-CoV-2 Detection: Interfacing Gel Switch Resonators with Cell-Free Toehold Switches.

ACS sensors 2022 Carr AR, Dopp JL, Wu K, Sadat Mousavi P 等 10 人

新冠疫情凸显了大规模检测对控制传染病传播的重要性。自疫情暴发以来,病毒和抗体检测方法的快速开发、规模化与部署显著提升了检测能力。理想检测方法应具备低成本、可自我操作以及可密封邮寄至中心实验室安全分析并录入公共卫生数据库的特点。本文展示了一种此类平台:以丝网印刷电感-电容(LC)谐振器作为换能器,以无细胞表达偶联的 toehold s...

Towards detection of SARS-CoV-2 RNA in human saliva: A paper-based cell-free toehold switch biosensor with a visual bioluminescent output.

New biotechnology 2022 Hunt JP, Zhao EL, Free TJ, Soltani M 等 10 人

新冠疫情凸显了对快速、低成本、可广泛分发且可在现场使用的核酸检测技术的迫切需求。传统核酸检测通常需要专业人员、复杂实验室、昂贵设备和较长处理时间。本研究采用冻干无细胞蛋白合成(CFPS)和toehold switch核糖调控器,开发了一种仅需加入唾液即可激活的纸基核酸检测平台。首先筛选出经济且供应稳定的纸基载体,并设计了可批量生产、...