传感器类型
侧流层析试纸条
检测对象
目标DNA(target DNA)、人基因组DNA(human genomic DNA);样品基质:超纯水、临床血液(提取的人基因组DNA)
检测原理
目标DNA与AuNPs偶联的发夹DNA探针杂交,使发夹茎区打开;链置换引物probe 2退火至开放茎区,Klenow聚合酶在dNTPs存在下延伸并置换目标链,形成带5'序列标签的双链DNA复合物。该过程循环进行,实现等温链置换聚合酶反应(ISDPR)信号放大。产物中probe 1携带AuNPs和3'生物素,probe 2携带5'标签;检测区固定的抗标签探针probe 4捕获标签序列,使AuNPs在检测线聚集形成红色条带。目标浓度越高,生成的标签双链复合物越多,检测线颜色越深,光密度值越大,可肉眼判读或用便携式试纸条读数仪半定量。
检测灵敏度
LOD: 0.01 fM;线性范围: 1 fM–1 pM;人基因组DNA LOD: 25 ng mL−1
效应效果
该传感器选择性高:随机序列DNA及含1–4个错配碱基的突变序列均不产生检测线,可区分单碱基突变。以HCV RNA、结核DNA和猪DNA为阴性对照均无检测线;40份临床血液样本提取的人基因组DNA均呈阳性,并与PCR结果一致。人基因组DNA检测限为25 ng/mL,满足血液样本检测需求。检测在30 min内完成,无需复杂仪器,可肉眼判读并用便携式试纸条读数仪半定量。作者指出其灵敏度比此前侧流方法高约1000倍,与ISDPR荧光/比色法相当或更高,虽低于PCR,但更快速、低成本,适用于现场和即时诊断。
传感器的构成
- 试纸条基底:硝酸纤维素膜(nitrocellulose membrane)、样品垫(sample pad)和吸收垫(absorbent pad),承载反应与层析
- 信号纳米材料:金纳米颗粒(AuNPs),提供红色比色信号
- 识别元件:5'-巯基-3'-生物素修饰发夹DNA探针(probe 1/probe 5),偶联AuNPs并含目标结合区
- 链置换引物:23-mer DNA探针(probe 2),5'端带序列标签,用于ISDPR延伸
- 目标触发探针:28-mer目标DNA探针(probe 3)或目标DNA,与发夹探针杂交触发链置换
- 酶促放大组分:Klenow聚合酶(exo-)、dNTPs和缓冲液,驱动等温链置换聚合酶反应
- 检测线捕获:抗标签DNA探针(probe 4, GAAAGATAGAAAGAT)固定于硝酸纤维素膜检测区
- 质控线捕获:链霉亲和素(streptavidin)固定于质控区,结合probe 1 3'端生物素
中文摘要
本文报道了一种基于等温链置换聚合酶反应(ISDPR)和金纳米颗粒(AuNPs)的侧流层析生物传感器,用于核酸的高灵敏、高选择性视觉检测。该传感器由样品垫、硝酸纤维素膜和吸收垫组成,AuNPs表面偶联5'-巯基、3'-生物素修饰的发夹DNA探针;目标DNA与探针杂交后打开发夹结构,链置换引物退火并在Klenow聚合酶作用下延伸,通过链置换循环放大产生大量带序列标签的双链DNA复合物。检测区固定的抗标签DNA探针捕获该复合物,使AuNPs聚集形成红色检测线;质控区链霉亲和素结合生物素探针形成质控线。以合成目标DNA为模型,传感器在30 min内可肉眼检出0.01 fM目标DNA,线性范围为1 fM–1 pM;对人基因组DNA的检测限约为25 ng/mL,40份临床血液样本均呈阳性并与PCR结果一致。该试纸条无需复杂仪器,可用于现场和即时诊断。
英文摘要
A lateral flow biosensor based on isothermal strand-displacement polymerase reaction and gold nanoparticles has been developed for the visual detection of nucleic acids with a detection limit of 0.01 fM.