电化学生物传感器 2012

A sensitive electrochemical biosensor for detection of DNA methyltransferase activity by combining DNA methylation-sensitive cleavage and terminal transferase-mediated extension.

Chemical communications (Cambridge, England) Wu H, Liu S, Jiang J, Shen G, Yu R
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组成图示

A sensitive electrochemical biosensor... 传感器构成示意图

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传感器类型

电化学生物传感器

检测对象

DNA甲基转移酶活性(DNA methyltransferase activity,以DNA腺嘌呤甲基转移酶Dam MTase为模型)、5-氟尿嘧啶(5-fluorouracil);样品基质:缓冲液/酶反应液

检测原理

金电极表面自组装3'-巯基发夹DNA探针S1,其5'-GATC-3'序列作为Dam MTase底物。Dam MTase在SAM存在下将甲基转移至腺嘌呤N6位,形成5'-GAmTC-3';甲基化敏感限制性内切酶Dpn I识别并切割该序列,在电极表面产生带3'-OH末端的新引物。末端转移酶TdTase将生物素化dUTP(dUTP-biotin)特异性掺入3'-OH末端,降低非特异背景。链霉亲和素-碱性磷酸酶SA-ALP结合生物素,ALP催化电化学惰性1-萘磷酸(1-NP)转化为电活性酚。DPV检测酚氧化峰,Dam MTase活性越高,切割与延伸越多,生物素/ALP越多,氧化电流越大;加入抑制剂则电流下降。酶促催化1-NP转化实现信号放大。

检测灵敏度

LOD: 0.04 U mL−1;线性范围: 0.1–20 U mL−1(对数线性)

效应效果

该传感器在Dam MTase存在时产生强DPV氧化峰,无酶或不含特异识别序列的控制探针仅有很小或不显著氧化峰,表明识别序列依赖性和选择性。加入600 μM 5-氟尿嘧啶后氧化峰显著降低,说明可检测Dam MTase抑制剂并用于抑制剂筛选。作者指出该方法无需复杂仪器,Dam MTase检出限达0.04 U/mL,低于多数已报道方法,并克服了抑制剂对甲基化敏感限制性内切酶活性的影响,具有DNA MTase活性定量和抑制剂筛选应用潜力。原文未报告RSD、稳定性或实际样品回收率。

传感器的构成

  • 基底/换能器电极:金电极(Au electrode),提供Au-S自组装界面与DPV电化学换能
  • 识别/底物探针:3'-巯基发夹DNA探针(3'-SH hairpin DNA probe, S1),含Dam MTase识别序列5'-GATC-3'
  • 甲基化酶:DNA腺嘌呤甲基转移酶(Dam MTase),催化SAM甲基转移至腺嘌呤N6位
  • 切割酶:甲基化敏感限制性内切酶Dpn I(Dpn I),识别并切割5'-GAmTC-3'产生3'-OH新引物
  • 延伸酶与底物:末端转移酶(TdTase)与生物素化dUTP(dUTP-biotin),将生物素掺入新引物3'-OH末端
  • 信号标记物:链霉亲和素-碱性磷酸酶(SA-ALP),结合生物素并携带ALP
  • 电化学底物:1-萘磷酸(1-NP),被ALP催化转化为电活性酚,用于DPV信号放大

中文摘要

本文报道一种新型电化学生物传感器,用于DNA甲基转移酶(MTase)活性及其抑制剂检测。该传感器基于甲基化敏感切割激活引物,随后由末端转移酶(TdTase)介导生物素化dUTP延伸,并通过酶促放大实现敏感检测。以DNA腺嘌呤甲基转移酶(Dam MTase)为模型,3'-巯基发夹DNA探针自组装于金电极表面作为底物;Dam MTase将S-腺苷甲硫氨酸(SAM)的甲基转移至特定序列腺嘌呤,形成甲基化序列,被Dpn I切割产生带3'-OH末端的新引物;TdTase将dUTP-biotin掺入引物末端,链霉亲和素-碱性磷酸酶(SA-ALP)结合生物素,ALP催化1-萘磷酸(1-NP)生成电活性酚,差分脉冲伏安法(DPV)读出。该法无需复杂仪器,Dam MTase检出限为0.04 U/mL,线性范围为0.1–20 U/mL,并可筛选5-氟尿嘧啶等抑制剂。

英文摘要

A novel electrochemical biosensor was developed for activity assay of DNA methyltransferase and its inhibitor based on methylation-sensitive cleavage, which activated a primer for terminal transferase-mediated extension of biotinylated dUTP followed by sensitive detection via enzymatic amplification.