The Growth Dependent Design Constraints of Transcription-Factor-Based Metabolite Biosensors.

ACS synthetic biology 2022 Hartline CJ, Zhang F

基于代谢物响应转录因子的代谢物生物传感器是合成生物学中用于感知和精确调控细胞代谢的关键元件。此类传感器通常在实验室条件下设计，但实际部署时细胞生长速率可能与初始表征差异很大。本文研究生长速率如何影响生物传感器的最低输出、最高输出和动态范围等关键性能指标。作者以大肠杆菌中 LacI、TetR 和 FadR 基生物传感器为模型，发现不同...

全细胞生物传感器 代谢物生物传感器转录因子动态范围生长速率

Trade-Offs in Biosensor Optimization for Dynamic Pathway Engineering.

ACS synthetic biology 2022 Verma BK, Mannan AA, Zhang F, Oyarzún DA

合成生物学进展使代谢工程可构建动态控制回路，使其能够响应生物反应器扰动并自我调节基因表达，有望克服传统通路工程中的诸多难题。这些回路的核心是代谢物生物传感器，用于读取通路信号并驱动酶表达。然而，代谢物生物传感器的构建是菌株设计的主要瓶颈，关键挑战在于理解生物传感器剂量-响应曲线与通路性能之间的关系。本文采用多目标优化方法，定量刻画代...

其他 代谢物生物传感器动态通路工程多目标优化转录因子