10.1039/d0ra09123e
严重急性呼吸综合征冠状病毒2（SARS-CoV-2）通过刺突蛋白受体结合域（RBD）结合宿主ACE2受体完成感染。本研究以阻断RBD-ACE2结合为目标，对12条候选肽进行计算筛选，利用原子尺度分子动力学模拟评估其与RBD的结合能力、氢键作用、RMSD及水溶液稳定性，并通过伞形采样平均力势（PMF）计算验证结合。结果显示肽6和肽7兼...
Computational design of single-stranded DNA hairpin aptamers immobilized on a biosensor substrate.
适配体与附着表面的相互作用是适配体生物传感器设计与性能的核心。本文建立了一种计算建模方法，用于研究不同系统设计，包括适配体连接端、表面密度、取向和溶剂条件，并将其应用于固定在二氧化硅（SiO2）生物传感器基底上的抗MUC1单链DNA发夹适配体。MUC1是上皮癌早期检测的重要生物标志物，抗MUC1适配体为23个核苷酸的DNA发夹结构，...