Journal of computer-aided molecular design
2015
Feng T, Zhang Y, Ding JN, Fan S 等 5 人
大环内酯生物传感器蛋白 MphR(A) 是代谢物感应与基因表达调控的关键蛋白。MphR(A) 结合红霉素（erythromycin, Ery）后释放基因操纵子，激活 mphA 基因表达并启动红霉素耐药。V66L 和 V126L 突变可能破坏 Ery 与 MphR(A) 的结合。本研究采用分子动力学模拟，比较野生型 MphR(A) 与...
The journal of physical chemistry letters
2015
Luan B, Huynh T, Zhou R
为加速药物发现中的先导化合物优化，作者提出一种基于纳米孔力谱（NFS）的电学传感方法，用于检测候选药物分子与靶蛋白之间的结合强度。该方法将药物样肽通过二硫键连接带负电的单链 DNA 片段，使其在偏置电压下电泳进入固态 SiO2 纳米孔；靶蛋白因尺寸较大被捕获在孔口，造成离子电流阻塞。继续升高电压时，孔内电场增强，当电驱动力超过结合能...
The journal of physical chemistry. B
2015
Rhinehardt KL, Srinivas G, Mohan RV
适配体传感器利用适配体作为生物识别元件，适配体高效、高特异且可重复使用。在传感器中，适配体需固定化以最大化接触目标分子。计算建模可揭示适配体与肽结合时的取向和位置。实验上，anti-MUC1 S2.2适配体可识别乳腺癌生物标志物黏蛋白1（MUC1）蛋白中多种含APDTRPAP序列的肽段变体。理解肽-适配体复合物结合区域的取向和位置对...