3 条结果 关键词:分子动力学模拟 ×

Control of Protein Conformation and Orientation on Graphene.

Journal of the American Chemical Society 2019 Wei S, Zou X, Tian J, Huang H 等 6 人

石墨烯基生物传感器因无标记检测和高灵敏度而受到关注。许多此类传感器利用非共价范德华力将蛋白质固定到石墨烯表面,同时保持石墨烯高导电性。保持蛋白质天然结构、避免去折叠或显著构象变化,并控制其在石墨烯表面的合适取向,是决定传感性能的关键。本文基于前期石墨烯与肽段氨基酸残基相互作用的实验和建模知识,系统重新设计模型蛋白,以改善其在石墨烯上...

Dynamics and molecular interactions of single-stranded DNA in nucleic acid biosensors with varied surface properties.

Physical chemistry chemical physics : PCCP 2019 Cholko T, Kaushik S, Chang CA

利用自组装单分子层(SAM)并插入 DNA 探针的电化学 DNA 生物传感器因制备简便、可微型化和可调性而具有应用前景,但 DNA 等生物分子与不同表面之间的相互作用仍不清楚。一个基本问题是靶分子在传感器表面的扩散性质,以及这种表面扩散是否会加速分子识别过程。目前对分子相互作用、表面扩散以及固定化 DNA 探针行为的理解不足,限制了...

Pinpointing the L-phenylalanine binding sites of TyrR using biosensors and computer-aided simulation.

Biotechnology letters 2019 Bai D, Ding D, Li J, Cong L 等 5 人

本研究旨在通过理性突变分析、生物传感器与计算机辅助模拟相结合,确定大肠杆菌 TyrR 蛋白中 L-苯丙氨酸(L-Phe)的结合位点。TyrR 是芳香族氨基酸合成与转运相关基因的主要转录调控因子,其配体结合位点的鉴定是蛋白功能注释和基于结构的蛋白设计的重要基础。作者构建了以 tyrP 启动子驱动绿色荧光蛋白(GFP)表达、并携带 Ty...