Quantitative comparison between sub-millisecond time resolution single-molecule FRET measurements and 10-second molecular simulations of a biosensor protein.

PLoS computational biology 2020 Girodat D, Pati AK, Terry DS, Blanchard SC 等 5 人

分子动力学（MD）模拟旨在以实验相关时间分辨率提供构象动态生物系统的原子级洞察，但模拟时间尺度与单分子荧光测量时间分辨率的限制使二者难以在重叠时间域内定量比较。本文报道了与体外单分子 Förster（荧光）共振能量转移（smFRET）测量时间尺度重叠的氨基酸结合蛋白 LIV-BPSS 的 MD 模拟，时间分辨率达亚毫秒。研究采用经显...

荧光生物传感器 单分子FRET分子动力学模拟LIV-BPSS构象动力学

Simulated revelation of the adsorption behaviours of acetylcholinesterase on charged self-assembled monolayers.

Nanoscale 2020 Yang S, Liu J, Zheng H, Zhong J 等 5 人

基于乙酰胆碱酯酶（AChE）的电化学生物传感器因简单、快速、可靠且成本低，被用于有机磷和氨基甲酸酯农药检测。AChE 在电极表面的生物活性及直接电子转移（DET）速率决定传感器性能，带电表面对其检测能力影响显著。本研究采用平行退火蒙特卡洛（PTMC）和全原子分子动力学（AAMD）模拟，考察加州电鳗 AChE（TcAChE）在带相反电...

综述或非传感器论文 乙酰胆碱酯酶自组装单分子层分子动力学模拟有机磷农药