我们开发了用于尼古丁检测的荧光蛋白传感器，并提高了其灵敏度。在 pH 7.4 下，iNicSnFR12 的 ΔF/F0 对尼古丁浓度的比例常数（δ-slope）为 2.7 μM−1，比先前报道的 iNicSnFR3a 高 6.1 倍。iNicSnFR12 激活态的荧光量子产率至少为 0.6。我们对尼古丁诱导的吸收增强和荧光增强测得相...
本研究报道了一类双吲哚马来酰亚胺（Bisindolylmaleimides, BIMs）化合物作为钙调蛋白（calmodulin, CaM）潜在抑制剂的分子水平相互作用。BIMs 是源自斯他唑星（staurosporine）的药物原型，其中 BIM II、IV、VII、X 和 XI 首次被提出并报道为可能的 CaM 抑制剂。研究采用...
荧光标记的溶质结合蛋白可因配体结合而改变荧光输出，被广泛用于多种生物传感器。作者此前开发了“计算识别非干扰连接位点”（CINC）方法，利用分子动力学模拟快速设计和构建蛋白–荧光团偶联型生物传感器。本文报告了用于CINC的改进计算评分算法FScore2.0，并据此构建了一组寡半乳糖醛酸检测生物传感器。该算法重点分析蛋白空载态与配体结合...
荧光标记的溶质结合蛋白可因配体结合而改变荧光输出，已被用于多种生物传感器。传统方法常需对多个标记位点和多种荧光团进行试错筛选，过程费时，并可能降低配体结合亲和力或改变特异性。本文提出计算识别非破坏性偶联位点（CINC）方法，用于简化荧光团偶联位点的筛选。CINC 利用蛋白结构动力学性质，识别在偶联荧光团后仍能于配体结合时产生荧光变化...
本研究利用 hCaM-M124C-mBBr 荧光生物传感器和分子动力学（MD）模拟，考察四种钙调蛋白（CaM）相关肽在不同钙当量下与 CaM 的相互作用。由于该生物传感器灵敏度高，作者根据每种肽在不同钙当量下的荧光滴定结果计算了五个解离常数（Kd），发现钙饱和度与 Calspermin、nNOS 和 skMLCK 肽亲和力呈正相关；...
本文针对此前报道的一种用于检测无机磷酸盐（Pi）的蛋白荧光生物传感器进行结构预测。该传感器以大肠杆菌磷酸结合蛋白（PBP）为支架，并在 A17C 和 A197C 突变位点共价连接两个四甲基荧光素（RHO）荧光团。作者采用经典分子动力学和 Car–Parrinello/分子力学（CP/MM）混合模拟，分别构建无 Pi 和有 Pi 状态...
活体荧光成像已成为追踪细胞内多种分子事件时空定位的有力工具。基于 Förster 共振能量转移（FRET）的遗传编码荧光指示剂被常规使用，但调控其功能的分子基础尚未完全阐明。本文以蛋白激酶 A 调节亚基的 cAMP 结合域为基础，介绍一种常用 cAMP FRET 传感器的结构与动力学性质。采用隐式溶剂分子动力学模拟，定位 cAMP ...