3 条结果 关键词:分子动力学 ×

Domain communication in Thermotoga maritima Arginine Binding Protein unraveled through protein dissection.

International journal of biological macromolecules 2018 Smaldone G, Balasco N, Vigorita M, Ruggiero A 等 9 人

底物结合蛋白是一类在代谢物跨膜选择性转运中发挥关键作用的蛋白家族,其功能依赖于两个结构域的相对运动。本文以海栖热袍菌精氨酸结合蛋白(TmArgBP)为模型,通过蛋白切割研究该家族中的域间通讯。将 TmArgBP 切割为 D1 和 D2 两个结构域,并采用多种实验与计算技术系统表征其稳定性、晶体结构、精氨酸识别能力及动力学。结果表明,...

Insight into the Molecular Mechanisms of AuNP-Based Aptasensor for Colorimetric Detection: A Molecular Dynamics Approach.

Langmuir : the ACS journal of surfaces and colloids 2018 Phanchai W, Srikulwong U, Chompoosor A, Sakonsinsiri C 等 5 人

基于盐诱导金纳米颗粒(AuNP)聚集的比色适配体传感器是一种有前景的生物传感器,但其分子机制尚未完全阐明。本文采用分子动力学(MD)模拟,研究赭曲霉毒素A(OTA)检测中的分子相互作用,包括:(i)抗OTA适配体的分子识别;(ii)一价钠离子(Na+)和二价镁离子(Mg2+)电解质中OTA与适配体的相互作用;(iii)柠檬酸在AuN...

Structural basis of pesticide detection by enzymatic biosensing: a molecular docking and MD simulation study.

Journal of biomolecular structure & dynamics 2018 Shahbaaz M, Kanchi S, Sabela M, Bisetty K

设计快速、简便、选择性高且低成本的生物传感器技术,是检测各类农药的重要方向。本文通过分子对接、特异性倾向分析和蛋白质识别能力评估,探讨农药检测的酶生物传感结构基础。研究选取乙酰胆碱酯酶(ACH)、细胞色素P450(CYP)、谷胱甘肽S-转移酶(GST)和蛋白激酶C(PKC)四种候选生物识别蛋白,分别对应神经递质、代谢、解毒和蛋白磷酸...