PloS one
2024
Jauhar MM, Damairetha FR, Mardliyati E, Ulum MF 等 9 人
心血管疾病每年导致约47万例死亡,其中心肌梗死占49.2%,人肌钙蛋白I(cTnI)是诊断心肌梗死的关键生物标志物。基于肽的生物识别元件具有合成容易、成本低、稳定性好和分子量小等优点,是开发快速、高效、选择性cTnI检测方法的潜在候选,但相关研究仍不足。为此,本研究采用生物信息学方法设计新的cTnI生物传感器候选肽,并提出新的计算优...
Scientific reports
2024
Deshpande P, De D, Badhe Y, Tallur S 等 6 人
皮质醇是评估压力的可靠生物标志物,推动通过外泌汗液检测它的可穿戴传感器研究。由于汗液中皮质醇含量极低,通常为8–140 ng/mL,开发此类生物传感器需要具有合适灵敏度和选择性的生物受体。本文提出一种系统仿生方法和半自动高通量筛选工具,用于快速选择生物受体,替代从头计算肽学设计。首先从蛋白质数据库筛选候选蛋白,通过分子对接和Auto...
3 Biotech
2024
Chadha J, Mudgil U, Khullar L, Ahuja P 等 5 人
在后抗生素时代,抗毒力治疗难以直接替代现有抗菌方案,药物再利用成为重要替代策略。针对多重耐药铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa)造成的临床负担,本研究评估常用药物 fexofenadine(FeX)、ivermectin(IvM)、nitrofurantoin(NiT)、levocetrizine(LvC)、...
Computational and structural biotechnology journal
2024
Pham C, Stogios PJ, Savchenko A, Mahadevan R
基于转录因子(TF)的小分子生物传感器可将配体识别与荧光等读出相偶联,是合成生物学中有用的工具,但可用于目标分子的已表征 TF 有限。本研究提出一种基于分子对接的计算工作流,用于定向改变 TF 的配体特异性。作者以 LysR 家族 TF BenM 为对象,通过计算筛选获得单个氨基酸替代位点,将其天然配体 cis,cis-粘康酸(CC...