Encoding Genetic Circuits with DNA Barcodes Paves the Way for Machine Learning-Assisted Metabolite Biosensor Response Curve Profiling in Yeast.

ACS synthetic biology 2022 Zhou Y, Yuan Y, Wu Y, Li L 等 7 人

基因编码生物传感器是代谢工程中的有价值工具，但其剂量响应曲线的精细调节仍具挑战。为此，作者利用 DNA 可追踪组装方法与 FACS-seq 技术，建立了一种大规模并行构建和全面表征数千个生物传感器的新流程。以基于 FapR-fapO 的丙二酰辅酶A生物传感器为概念验证，构建了可追踪组合文库，包含 5184 种组合：6 个转录因子剂量...

全细胞生物传感器 基因编码生物传感器丙二酰辅酶AFACS-seq机器学习

Fundamental Design Principles for Transcription-Factor-Based Metabolite Biosensors.

ACS synthetic biology 2017 Mannan AA, Liu D, Zhang F, Oyarzún DA

代谢物生物传感器是精准工程化代谢的核心工具，但其可调性仍缺乏系统理解。本文研究遗传修饰如何塑造基于代谢物响应转录因子的生物传感器的剂量响应曲线。作者以大肠杆菌 lac 系统为模型，构建了一系列具有不同 LacI 结合 operator 位点的 lacUV5 启动子库，并测量其对 IPTG 的稳态 RFP 荧光响应。结果表明，oper...

全细胞生物传感器 代谢物生物传感器转录因子剂量响应曲线启动子工程